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中科院大連化物所發(fā)展胞內蛋白極紫外激光解離質譜新方法
2025年02月21日 11:13:05 來源:化工儀器網 作者:宋池 點擊量:719

中科院大連化物所與中國科學技術大學合作,成功開發(fā)出極紫外激光解離Top-Down質譜表征(UVPD-TDMS)新技術,用于細胞內蛋白質的原位質譜表征和變體構象異質性解析。該技術揭示了胞內鈣調蛋白的構象多樣性,展示了在解析蛋白質構象異質性方面的強大能力,為細胞內蛋白質的結構和功能研究提供了新的技術手段。

  近日,中國科學院大連化學物理研究所(大連化物所)生物技術研究部的生物分子結構表征新方法研究組(1822組)與中國科學技術大學的研究團隊攜手,發(fā)展了胞內蛋白極紫外激光解離Top-Down質譜表征(UVPD-TDMS)新方法,為細胞內蛋白質的原位質譜表征和變體構象異質性的解析提供了創(chuàng)新性分析技術。
 
  Top-Down質譜技術是一種直接從完整蛋白質分子出發(fā),進行質量分析和結構解析的方法。與傳統(tǒng)的Bottom-Up方法(即先將蛋白質水解成肽段再進行質譜分析)相比,Top-Down方法能夠保留蛋白質的完整構象信息,從而更真實地反映蛋白質在細胞內的狀態(tài)。然而,細胞內蛋白質的復雜性和多樣性使得Top-Down質譜技術的應用面臨諸多挑戰(zhàn)。
 
  在本工作中,研究團隊通過誘導電噴霧離子化裝置,成功實現(xiàn)了大腸桿菌細胞內高表達鈣調蛋白的原位離子化及質譜直接檢測。實驗結果顯示,胞內鈣調蛋白存在多種構象共存的現(xiàn)象,并且與純化蛋白相比,胞內鈣調蛋白展現(xiàn)出更高豐度的伸展構象。這一發(fā)現(xiàn)揭示了細胞內蛋白質構象的真實狀態(tài),也驗證了UVPD-TDMS技術在胞內蛋白分析中的獨特優(yōu)勢。
 
  團隊進一步利用UVPD-TDMS技術對不同Ca2+結合變體的構象進行了深入分析。研究發(fā)現(xiàn),Ca2+的結合能力受到蛋白質構象的調控,緊湊構象相比伸展構象具有更高的Ca2+結合能力。此外,Ca2+的結合位點偏好性也受到構象的影響。這些發(fā)現(xiàn)不僅為理解細胞內蛋白質的功能調控提供了新的視角,也展示了UVPD-TDMS技術在解析蛋白質構象異質性方面的強大能力。
 
  此次研究不僅成功開發(fā)出UVPD-TDMS技術,還提出了胞內蛋白原位TDMS表征的新概念。通過對質量和電荷分布的精確選擇,實現(xiàn)了胞內蛋白變體和構象特異性的UVPD-TDMS分析。同時,團隊還展示了a-、x-、c-、z-光解離特征碎片在表征變體構象異質性方面的獨特優(yōu)勢。
 
  相關研究成果以“In-Cell Mass Spectrometry and Ultraviolet Photodissociation Navigates the Intracellular Protein Heterogeneity”為題,近日在《美國化學會志》(Journal of the American Chemical Society)上發(fā)表。該工作得到了國家重點研發(fā)計劃、國家自然科學基金以及大連化物所創(chuàng)新基金等項目的資助。
 
  素材來源:中國科學院大連化學物理研究所
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