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細(xì)胞STR鑒定
閱讀：1037 發(fā)布時間：2021-3-1細(xì)胞STR鑒定應(yīng)用于生物醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域的哺乳動物細(xì)胞被錯誤鑒定和交叉污染的問題，一直是一個普遍存在的突出問題。
據(jù)統(tǒng)計，國外實驗室有20%左右的細(xì)胞株被錯誤鑒定和交叉污染，NIH和ATCC近兩年都對此發(fā)出呼吁，要求研究者對細(xì)胞進(jìn)行鑒定。近年來，大量研究表明STR基因分型方法是進(jìn)行細(xì)胞交叉污染和性質(zhì)鑒定的效和準(zhǔn)確的方法之一，STR基因分型應(yīng)用于細(xì)胞鑒定已被ATCC等機(jī)構(gòu)強烈推薦。美國的ATCC細(xì)胞庫、德國的DSMZ細(xì)胞庫以及日本的JCRB細(xì)胞庫等為STR分型提供了各細(xì)胞株的數(shù)據(jù)供比對。
STR（Short Tandem Repeat，短串聯(lián)重復(fù)序列）基因位點由長度為3-7個堿基對的短串連重復(fù)序列組成，這些重復(fù)序列廣泛存在于人類基因組中，可作為高度多態(tài)性標(biāo)記，被稱為細(xì)胞的DNA指紋，其可通過PCR（聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)）來檢測。STR基因座位上的等位基因可通過擴(kuò)增區(qū)域內(nèi)重復(fù)序列的拷貝數(shù)的不同來區(qū)分，在毛細(xì)管電泳分離之后可通過熒光檢測來識別。隨后通過一定的計算方法，即可根據(jù)所得的STR分型結(jié)果與專業(yè)的細(xì)胞STR數(shù)據(jù)庫比對從而推算出樣品所屬的細(xì)胞系或可能的交叉污染的細(xì)胞系名稱。
細(xì)胞STR鑒定服務(wù)流程：
細(xì)胞STR鑒定樣本要求：
細(xì)胞系錯誤鑒定所造成的后果：
★ 細(xì)胞系的損失；
★ 時間和金錢的損失；
★ 在公眾領(lǐng)域（文獻(xiàn)、等）提供錯誤信息；
★ 造成實驗結(jié)果不一致或不可重復(fù)；
★ ……
何時需做細(xì)胞STR鑒定？
1、發(fā)表文章或申請課題經(jīng)費前；
2、使用細(xì)胞進(jìn)行臨床治療（試驗）前；
3、準(zhǔn)備凍存保種或已凍存多年的細(xì)胞；
4、一個涉及到細(xì)胞試驗項目開始/結(jié)束時；
5、新得到的細(xì)胞或?qū)嶒炇覀?代以上的細(xì)胞；
6、細(xì)胞系表現(xiàn)不穩(wěn)定或結(jié)果與預(yù)期差別較大。
已開始要求細(xì)胞鑒定的期刊：
★ Nature
★ BioTechniques
★ Cancer Research
★ Cancer Discovery
★ Clinical Cancer Research
★ Molecular Cancer Research
★ Cancer Prevention Research
★ International Journal of Cancer
★ Molecular Cancer Therapeutics
★ Cell Biochemistry and Biophysics
★ Cancer Epidemiology, Biomarkers & Prevention
★ In Vitro Cellular & Developmental Biology - Animal
★ ......
人源細(xì)胞STR位點信息：
為進(jìn)一步提高鑒定的分辨率，除了包含ATCC檢測的8個STR和1個性別決定位點Amelogenin外，另新增了12個高度多態(tài)性位點，共檢測21個STR位點。