WB蛋白質(zhì)印跡法:常出現(xiàn)的問題及需要注意的事項(xiàng)!
WB技術(shù)用抗體檢測(cè)特定抗原,操作需注意蛋白樣品準(zhǔn)備、制膠、加樣、電泳、封閉和顯色等步驟,結(jié)果不理想時(shí)需自查原因并調(diào)整操作。
Western Blot即蛋白免疫印跡,行話常常將其稱為WB,是將細(xì)胞或組織總蛋白質(zhì)通過電泳從凝膠轉(zhuǎn)移到固相支持物NC膜(硝酸纖維素薄膜)或PVDF(聚偏二氟乙烯膜)膜上,然后用特異性抗體檢測(cè)某特定抗原的技術(shù)。
該技術(shù)中被檢測(cè)的特定抗原指目的蛋白。特異性抗體指一抗和二抗(二抗是指一抗的抗體,如一抗是從兔中獲得的,則二抗就是抗兔 IgG 的抗體,兩者可特異性結(jié)合)。
使用“一抗”作為“探針”, 標(biāo)記的二抗用來“顯色”。轉(zhuǎn)移蛋白質(zhì)后的 NC 膜或PVDF膜就稱為一個(gè)印跡(因?yàn)镹C膜價(jià)格便宜,使用人數(shù)眾多,后續(xù)均以NC 膜為例)。
將印跡用蛋白溶液如 5%BSA(Bovine Serum Albumin 牛血清白蛋白)或 脫脂奶粉溶液或者從公司購買的封閉液處理,封閉 NC 膜上的疏水結(jié)合位點(diǎn)。再用目標(biāo)蛋白的抗體(一抗)處理 NC 膜只有目的蛋白才能與一抗特異結(jié)合形成抗原抗體復(fù)合物,這樣清洗掉未結(jié)合的一抗后,僅在目的蛋白的位置上結(jié)合著一抗。將一抗處理過的 NC 膜用標(biāo)記的二抗處理,。
處理后,帶有標(biāo)記的二抗與一抗特異性結(jié)合,可以指示一抗和目的蛋白結(jié)合的位置。WB技術(shù)現(xiàn)已廣泛應(yīng)用于蛋白水平的表達(dá)研究、抗體活性檢測(cè)和疾病早期診斷等多個(gè)研究領(lǐng)域。
對(duì)于新手朋友來說在做WB時(shí)可能遇到很多問題。就來介紹一下WB的操作和注意事項(xiàng)。
注意,因各個(gè)實(shí)驗(yàn)室條件不同,本文僅供參考,請(qǐng)根據(jù)所在實(shí)驗(yàn)室和課題組確定適宜的操作步驟。
WB操作中需要注意事項(xiàng)
一、蛋白樣品的準(zhǔn)備
1、樣品質(zhì)量
所抽取樣品的蛋白含量,蛋白變性是否充分等等,還有,蛋白樣品的PH值是否在7~8之間。這會(huì)直接影響到樣品濃縮的效果。此外,蛋白樣品是否降解、目的蛋白是否已抽取充分都會(huì)對(duì)結(jié)果的可靠性有影響。
2、細(xì)胞水平要做WB,多少細(xì)胞提的蛋白夠做WB
一般5×106就足夠
3、小分子量蛋白10KD需要的注意點(diǎn)
1)可選擇孔徑0.22um的PVDF膜或者NC膜,轉(zhuǎn)膜時(shí)間縮短,另外可采用Tricine-SDS-PAGE體系
2)也可以選擇PSQ膜,同時(shí)縮短轉(zhuǎn)移時(shí)間。也可以將兩張膜疊在一起,再轉(zhuǎn)移。其他按步驟即可
4、大分子量蛋白200KD需要的注意點(diǎn)
1)做200kd蛋白的WB時(shí)要注意,分離膠選擇>7%的;剝膠時(shí)要小心
2)轉(zhuǎn)移時(shí)間需要相應(yīng)延長(zhǎng);要做分子量參照(否則出現(xiàn)雜帶不知道如何分析)
3)轉(zhuǎn)膜液中甲醇含量可適當(dāng)降低,推薦使用濕裝轉(zhuǎn)膜效率更高
二、制膠
1、凝膠質(zhì)量
不連續(xù)SDS-PAGE膠對(duì)凝膠的要求較高,分離膠的PH值應(yīng)在8.8左右,而濃縮膠的PH應(yīng)在6.8左右,不要差過0.5個(gè)PH單位,因?yàn)檫@個(gè)PH條件是保證電泳液中的甘氨酸不電離的必要條件,也是保證能充分壓縮樣品的前提。
因此,制備凝膠的時(shí)候所用Tris-HCl緩沖液的PH值是否穩(wěn)定是很重要的。
2、在用ddH2O壓分離膠的時(shí)候?yàn)槭裁唇?jīng)常存在中間凸的現(xiàn)象
1)加水時(shí)不能對(duì)著膠沖,要沿著玻璃板緩慢流行
2)加水滿后一定要保證上方水平面是平齊的
3)加膠要避免氣泡,也要避免加膠太慢而提前凝固等現(xiàn)象
4)有其他人的經(jīng)驗(yàn)是用異丙醇封膠封膠后左右晃一下
三、加樣
1、點(diǎn)樣
樣品盡量不要與電泳液混合,這樣能提高濃縮的效果,因?yàn)殡娪疽?/span>PH值為8.3,而樣品為7.5,混合后會(huì)影響到樣品的PH值,進(jìn)而影響濃縮效果。因此,建議點(diǎn)樣用頭,或者加樣器,輕輕的將樣品加到孔的底部。
2、如果上樣量超載,要用什么方法來增加上樣量
可以濃縮樣品,也可以根據(jù)目標(biāo)分子量透析掉一部分小分子蛋白。一般地,超載30%是不會(huì)有問題的。如果已經(jīng)超了不少了,而且小分子量的也要,可以考慮加大膠的厚度,可以試試1.5mm的。
四、電泳
1、電泳緩沖液
盡量用新鮮配制的。這樣能保證PH值和離子強(qiáng)度的穩(wěn)定
2、電壓條件我們經(jīng)常用的濃縮時(shí)80V,分離時(shí)100V比較好,條帶很平
3、轉(zhuǎn)膜
膜的選擇主要從實(shí)驗(yàn)?zāi)康暮蛯?shí)驗(yàn)要求來考慮。例如,要做分子量小于20kD的小蛋白,0.45μm的NC膜是不可取的,因?yàn)檫@樣可能會(huì)使得蛋白因透過膜孔而造成膜結(jié)合的目的蛋白量不確定,從而影響到結(jié)果的可靠性。
而如果所分離的蛋白需要進(jìn)行測(cè)序,則非PVDF膜不可,因?yàn)橹挥蠵VDF膜才能經(jīng)受住嚴(yán)酷的清洗條件。
五、封閉
1、封閉液的選用要求
1)常用封閉液為脫脂牛奶(GBCBIO-232100)、牛血清白蛋白(BSA GBCBIO-0332)、無蛋白封閉液(GBCBIO-G7205)等
2) 封閉時(shí)間:室溫1-2h、4度過夜或37度半小時(shí)
3) 封閉液pH:一般5%脫脂牛奶pH大約為6.0-6.5左右,而1%脫脂牛奶可能6.5-7
4) 個(gè)人經(jīng)驗(yàn):5%脫脂牛奶封閉效果,但有時(shí)也可能封閉過度,可以與BSA或無蛋白封閉液輪流更換
六、顯色
1、抗體雜交與底物顯色
一抗盡量選擇小鼠或者兔來源的單克隆抗體,還有要注意所用的抗體是否能夠識(shí)別變性條件下的目標(biāo)蛋白;
二抗一般都是效價(jià)很高的,只要室溫下雜交1小時(shí)就可以了,適當(dāng)延長(zhǎng)也是可以的。另外,要選擇靈敏度較高的化學(xué)反應(yīng)底物。
2、WB中抗體的可以重復(fù)應(yīng)用嗎
抗體工作溶液一般不主張儲(chǔ)存反復(fù)使用,但是如抗體比較珍貴,可反復(fù)使用2-3次。稀釋后應(yīng)在2-3天內(nèi)使用,4度保存,避免反復(fù)凍融。
3、免疫組化和WB可以用同一種抗體嗎
免疫組化時(shí)抗體識(shí)別的是未經(jīng)變性處理的抗原決定簇(又稱表位),有些表位是線性的,而有的屬于構(gòu)象型;線性表位不受蛋白變性的影響,天然蛋白和煮后的蛋白都含有;構(gòu)象型表位由于受蛋白空間結(jié)構(gòu)限制,煮后變性會(huì)消失。如果所用的抗體識(shí)別的是蛋白上連續(xù)的幾個(gè)氨基酸,也就是線性表位,那么這種抗體可同時(shí)用于免疫組化和WB,而如果抗體識(shí)別構(gòu)象形表位,則只能用于免疫組化。
WB結(jié)果不理想可能的原因自查從結(jié)果倒推操作過程中可能的問題,總的來說,WB結(jié)果不理想,
可能的問題主要集中在以下幾方面部分:
1、陰性結(jié)果的原因
1) 二抗條件過低:提高二抗?jié)舛?、延長(zhǎng)二抗孵育時(shí)間或孵育溫度
2) 一抗條件過低:提高一抗?jié)舛?、延長(zhǎng)一抗孵育時(shí)間或孵育溫度
3) 抗原過少:提高上樣量
4) 抗體種屬不兼容:一抗species reactivity中是否有需要檢測(cè)樣品的種屬來源,一抗與二抗是否相匹配
5) 酶活性:二抗上標(biāo)記的HRP或AP等酶活性降低,如抗體過期或反復(fù)化凍等
6) 封閉過度或封閉劑不兼容:降低封閉劑濃度、縮短封閉時(shí)間,或者更換封閉劑種類
7) 底物出現(xiàn)質(zhì)量問題:可以通過點(diǎn)雜交試驗(yàn)排除底物和酶活性問題
8) 抗體稀釋液pH:注意檢測(cè)pH是否在6-8
9)樣品不表達(dá)該目的蛋白
10)轉(zhuǎn)膜不足或過頭:優(yōu)化轉(zhuǎn)膜條件
11)其它:PVDF膜、保鮮膜質(zhì)量問題等
12)抗體質(zhì)量:換口碑穩(wěn)定的品牌抗體公司。
2、有雜帶或背景的原因
1)目的蛋白有多個(gè)修飾位點(diǎn),本身可以呈現(xiàn)多條帶,建議查閱文獻(xiàn)或進(jìn)行生物信息學(xué)分析,獲得蛋白序列的修飾位點(diǎn)信息,通過去修飾確定蛋白實(shí)際大小
2) 樣本處理過程中目的蛋白發(fā)生降解,建議加入蛋白酶抑制劑;樣本處理時(shí)在冰上操作
3)二聚體或多聚體存在,建議增加蛋白質(zhì)變性過程及強(qiáng)度
4)上樣量過高:降低上樣量,減少抗原含量
5)二抗條件過強(qiáng):降低二抗?jié)舛?、縮短二抗孵育時(shí)間或改變溫度等
6)一抗條件過強(qiáng):降低一抗?jié)舛?、縮短一抗孵育時(shí)間和改變溫度等
7)抗體質(zhì)量不:如特異性不好,建議購買品牌公司的抗體
8)一抗稀釋度不適宜,可以對(duì)抗體進(jìn)行滴度測(cè)試,選擇宜的抗體稀釋度
9)一抗孵育的溫度偏高,建議4℃結(jié)合過夜
10)抗體濃度過高或洗滌不夠,建議降低抗體濃度,增加洗滌次數(shù)和時(shí)間
11)膜清洗不全:增加清洗強(qiáng)度,如增加蕩洗次數(shù)、延長(zhǎng)清洗時(shí)間或加0.05-0.1%Tween 20等
12)ECL發(fā)光液本身因外源污染等原因存在很強(qiáng)的背景光,顯影可以顯示強(qiáng)的背景光,建議分裝A和B液和更換發(fā)光液
13)縮短壓片或曝光時(shí)間
14)膜沒有均勻濕透,建議使用 methanol浸透膜
15)電極不平衡或者加樣位置偏斜,可以調(diào)整電極和加樣
16)封閉不全:二抗與抗原有交叉反應(yīng),升高封閉劑濃度、延長(zhǎng)封閉時(shí)間或更換不同的封閉劑,孵育時(shí)保證封閉液浸沒轉(zhuǎn)印膜
17)封閉物使用不當(dāng),比如檢測(cè)生物素標(biāo)記的蛋白時(shí)不可用脫脂奶粉封閉;
18)封閉時(shí)間不夠,一般情況下室溫37度封閉1小時(shí)以上或者4度封閉過夜
19)抗體非特異性結(jié)合,可以降低抗體濃度,減少孵育時(shí)間
20)化學(xué)顯色底物過多,建議按說明書加入適量的顯色底物
3、為啥條帶形狀不好看
1)膠凝的不均勻或聚合不好,建議灌膠前將溶液充分混勻
2)某些樣品鹽濃度較高,建議除鹽或?qū)悠符}濃度調(diào)成一致
3) 緩沖液陳舊,成分改變,可以重配
4) 凝膠下面有氣泡,電泳前要先將氣泡趕走
5)電泳時(shí)溫度過高,可以降低電流或電壓
6)樣品中含有不溶性顆粒,建議樣品充分?jǐn)嚢杌靹?/span>
4、蛋白條帶位置(大?。┎粚?duì)
1)膠濃度不對(duì),不同濃度的膠跑出的蛋白條帶的位置可能有所偏差,可以調(diào)整濃度
2)抗體孵育不充分,建議增加抗體濃度,延長(zhǎng)孵育時(shí)間
3)酶失活,建議直接將酶和底物進(jìn)行混合,如果不顯色則說明酶失活了。選擇在有效期內(nèi)、有活性的酶聯(lián)物
4)目的蛋白存在翻譯后修飾或剪切體,建議查詢相關(guān)文獻(xiàn)確定
5)標(biāo)本中不含靶蛋白或靶蛋白含量太低,建議設(shè)置陽性對(duì)照比對(duì)結(jié)果,增加標(biāo)本上樣量
5、背景有黑色斑點(diǎn)或不均勻的白色斑點(diǎn)和暗背景上白色帶
1)抗體與封閉試劑反應(yīng),建議使用前過濾封閉試劑
2)HRP含量過高,建議降低酶聯(lián)二抗的濃度
3)HRP偶聯(lián)二抗中有聚集體,建議過濾二抗試劑,去除聚集體
4)抗體分布不均勻,建議孵育抗體時(shí)使用搖床
6、為什么我的細(xì)胞提取液中沒有檢測(cè)到目的蛋白
1)細(xì)胞中不表達(dá)這種蛋白質(zhì),換一種細(xì)胞
2)抗體不能識(shí)別目標(biāo)蛋白,多看看說明,是否有問題
3)可能是沒有保持低溫操作,樣品保存不當(dāng),樣品放置時(shí)間過長(zhǎng)
4)細(xì)胞中的蛋白質(zhì)被酶降解掉了,可加入蛋白酶抑制劑,抑制蛋白酶活性
7、我的目的帶很弱,如何加強(qiáng)
1)可以加大抗原上樣量,這是主要的
2)也可以將一抗稀釋比例降低
3)還可以延長(zhǎng)曝光時(shí)間
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