實(shí)驗(yàn)?zāi)康摹?/span>
1.掌握用CaCl2法制備感受態(tài)細(xì)胞的原理和方法。
2.學(xué)習(xí)和掌握質(zhì)粒DNA的轉(zhuǎn)化和重組質(zhì)粒的篩選方法。
【實(shí)驗(yàn)原理】
質(zhì)粒在不同的細(xì)菌之間轉(zhuǎn)移是微生物世界中一種普遍的現(xiàn)象,一個(gè)細(xì)菌品系通過(guò)吸收另一個(gè)細(xì)菌品系的質(zhì)粒DNA而發(fā)生了遺傳性狀的改變,這種現(xiàn)象叫做轉(zhuǎn)化,獲得了外源DNA的細(xì)胞稱為轉(zhuǎn)化子。
在基因克隆技術(shù)中,所謂轉(zhuǎn)化是指質(zhì)?;蛑亟M質(zhì)粒被導(dǎo)入受體細(xì)胞,表達(dá)相應(yīng)的選擇標(biāo)記基因,并在一定的培養(yǎng)條件下,在選擇性培養(yǎng)基上長(zhǎng)出轉(zhuǎn)化子的過(guò)程。
質(zhì)粒必須通過(guò)轉(zhuǎn)化進(jìn)入細(xì)菌細(xì)胞內(nèi),才能進(jìn)行擴(kuò)增和表達(dá),從而獲得大量的克隆基因,使我們能夠進(jìn)行進(jìn)一步的DNA操作,如亞克隆等;或者獲得其表達(dá)產(chǎn)物。轉(zhuǎn)化效率的高低與受體菌的生理狀態(tài)有關(guān)。細(xì)菌吸收外源DNA的能力最高時(shí)的狀態(tài)被稱為感受態(tài)細(xì)胞(competentcell)。
有些種類的細(xì)菌在其生長(zhǎng)的任一階段都處于感受態(tài),而另一些細(xì)菌只有處于某個(gè)生長(zhǎng)時(shí)期時(shí)(一般為對(duì)數(shù)生長(zhǎng)早、中期),才會(huì)處于感受態(tài),如本實(shí)驗(yàn)所用的大腸桿菌。用一定濃度的CaCl2處理對(duì)數(shù)生長(zhǎng)早中期的細(xì)菌可以大大提高細(xì)菌吸收周圍環(huán)境中的DNA分子的能力。
對(duì)這種現(xiàn)象的一種解釋是CaCl2能使細(xì)菌細(xì)胞壁的通透性增強(qiáng),從而提高轉(zhuǎn)化率。這種轉(zhuǎn)化方法稱為“化學(xué)法”。目前還可以使用電激的方法,通過(guò)瞬間的高壓電流,在細(xì)胞上形成孔洞,使外源DNA進(jìn)入胞內(nèi),從而實(shí)現(xiàn)細(xì)胞的轉(zhuǎn)化。
電激轉(zhuǎn)化的效率往往比化學(xué)法高出1到2個(gè)數(shù)量級(jí),達(dá)到1X108轉(zhuǎn)化子/μgDNA,甚至1X109轉(zhuǎn)化子/μgDNA,所以常用于文庫(kù)構(gòu)建時(shí)的轉(zhuǎn)化或遺傳篩選。
微生物轉(zhuǎn)化是基因工程的常用技術(shù),大腸桿菌是基因工程中常用的受體菌,本實(shí)驗(yàn)即是用前面實(shí)驗(yàn)獲得的重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化大腸桿菌細(xì)胞。
【試劑與器材】
〈一〉試劑
1.LB液體培養(yǎng)基:參見(jiàn)附錄
每組配200mL,其中100mL分裝于500mL三角瓶中,另各取3mL裝于2只大試管中,其余裝于裝于500mL三角瓶中,121℃高壓蒸汽滅菌20分鐘。
2.LB/Amp/IPTG/X-Gal平板(1):
配1LLB液體培養(yǎng)基,加入20g瓊脂粉和1支攪拌棒,同上高壓滅菌,趁熱取出置攪拌器上冷卻,待冷至55℃左右,加氨芐青霉素(Ampicillin)至終濃度100μg/ml(Amp儲(chǔ)存液一般為100mg/mL),倒平板,每皿倒約15mL,室溫放置過(guò)夜至冷凝水揮發(fā)干凈。使用前半小時(shí)在培養(yǎng)基表面加20μL50mg/mLX-gal和100μL0.1mol/LIPTG,涂勻,待這兩種化合物滲入瓊脂后,即可用于轉(zhuǎn)化菌的涂布。
每組制備LB平板2個(gè),LB/Amp平板5個(gè),LB/Amp/IPTG/X-Gal平板6個(gè)。
3.IPTG儲(chǔ)存液(0.1mol/L):1.2gIPTG加水至50ml,過(guò)濾除菌,4℃儲(chǔ)存。
4.X-gal儲(chǔ)存液:50mg/ml溶于二甲基甲酰胺溶劑中,過(guò)濾除菌,4℃儲(chǔ)存。
5.1mol/LCaCl2儲(chǔ)存液,使用濃度為0.1mol/L,CaCl2應(yīng)使用分析純,配100mL,高壓滅菌,全班用。
6.甘油(滅菌),全班50mL,同上高壓滅菌。
7.酸洗無(wú)菌玻璃珠,涂布平板用,用50mL三角瓶分裝,同上高壓滅菌,烘干備用。
〈二〉器材
1.37℃溫箱、水浴鍋、恒溫振蕩器等
2.高速冷凍離心機(jī)
3.微量移液器等
〈三〉菌株
大腸桿菌DH5α
【操作方法】
1、感受態(tài)細(xì)胞的制備(無(wú)菌操作)
1)從新鮮培養(yǎng)的LB平板上挑單個(gè)DH5α大菌落接種到3mLLB培養(yǎng)液中(2),37℃劇烈振蕩(210-240r/min)培養(yǎng)過(guò)夜(3)。
2)取1mL過(guò)夜培養(yǎng)物,接種到含100mLLB培養(yǎng)液的500mL錐瓶中,37℃劇烈振蕩,直至培養(yǎng)液中細(xì)菌濃度達(dá)到OD600為0.375-0.4(4)
3)培養(yǎng)物轉(zhuǎn)入2只50mL離心管中,冰上放置10分鐘,4,000r/min,4℃離心15分鐘,棄上清(5)。
4)將菌體懸浮于10~20mL預(yù)冷的0.1mol/LCaCl2溶液中,冰上放置20分鐘(6)。
5)4,000rpm,4℃,離心10分鐘,棄上清,然后將細(xì)菌輕輕懸浮在2ml0.1mol/LCaCl2溶液中(7)。若不立即進(jìn)行轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn),則進(jìn)行第6步操作,反之,則進(jìn)入轉(zhuǎn)化操作。
6)緩慢滴入甘油(滅菌)至終濃度為15%,輕柔混勻,將細(xì)菌分裝成0.5ml/每管,立即液氮冷凍,轉(zhuǎn)入-70℃冰箱儲(chǔ)存,可在2個(gè)月內(nèi)使用(8)。
2、感受態(tài)細(xì)胞的轉(zhuǎn)化
1)設(shè)計(jì)好實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目,如正、負(fù)對(duì)照(參考如下表格,按表格內(nèi)容操作);
2)從-80℃冰箱中取出分裝成0.5mL/每管的感受態(tài)細(xì)胞,置冰上5分鐘或緩慢流水淋至剛好解凍(10),立即分裝到預(yù)冷的1.5mL離心管中,每管體積參見(jiàn)上表,插入冰上待用;
3)對(duì)轉(zhuǎn)化管,加入連接產(chǎn)物DNA溶液,輕輕混勻;為保險(xiǎn)起見(jiàn),也可先加入一半的連接產(chǎn)物DNA溶液,輕輕混勻,剩下的一半置-20℃冰箱保存;
4)冰上放置30分鐘(11);
5)放入42℃水浴中,熱激40秒(12);
6)迅速插入冰上,放置5分鐘;
7)對(duì)第1、2項(xiàng),加入500μLLB培養(yǎng)基,其余加入250μLLB培養(yǎng)基,37℃震蕩培養(yǎng)1小時(shí)(13);
8)對(duì)第1項(xiàng),各取200μL直接用玻璃珠涂布于2個(gè)LB/Amp/IPTG/X-Gal平板上;對(duì)第2項(xiàng),分別取3、30和100μL細(xì)菌培養(yǎng)液,各加無(wú)菌水至150μL(不超過(guò)200μL)涂LB/Amp/IPTG/X-Gal平板(此步驟的目的是計(jì)算轉(zhuǎn)化率);對(duì)其余各項(xiàng),分別各取一半涂布于LB/Amp平板上,余下的轉(zhuǎn)化液置4℃冰箱保存(14)。倒置平板,37℃培養(yǎng)12-14小時(shí)。一般來(lái)說(shuō),含有活性半乳糖苷酶的細(xì)菌比無(wú)活性酶的細(xì)菌生長(zhǎng)慢,故過(guò)夜培養(yǎng)后可見(jiàn)到毫米大小的陽(yáng)性白色菌落而陰性的蘭色菌落只有針尖大?。?5)。
9)挑取白色菌落進(jìn)行鑒定(見(jiàn)下一個(gè)實(shí)驗(yàn))。
【注意事項(xiàng)與提示】
(1)倒平板時(shí)應(yīng)避免培養(yǎng)基溫度過(guò)高,若溫度過(guò)高,則加入的氨芐青霉素會(huì)失效,且培養(yǎng)基凝固后表面及皿蓋會(huì)形成大量冷凝水,易于造成污染及影響單菌落的形成。若用手掌感受培養(yǎng)基覺(jué)得很燙但尚可忍受時(shí),培養(yǎng)基溫度即為55℃左右。制備好的LB/Amp平板可于4℃冰箱儲(chǔ)存2個(gè)月,時(shí)間過(guò)長(zhǎng)氨芐青霉素將會(huì)失效。加了IPTG/X-Gal的LB/Amp平板最好現(xiàn)用。
(2)DH5α在平板上過(guò)夜生長(zhǎng)后,可置冰箱中保存一個(gè)月左右;接種新鮮的菌落或菌液有利于細(xì)菌細(xì)胞的同步快速生長(zhǎng),從而使細(xì)菌群體在達(dá)到一定的OD值后(0.375)大部分細(xì)胞都處于感受態(tài)。
(3)DH5α的生長(zhǎng)需要氧氣,劇烈振蕩的目的是提高培養(yǎng)基的溶氧量以利于細(xì)菌的生長(zhǎng)
(4)達(dá)到細(xì)菌對(duì)數(shù)生長(zhǎng)早、中期,需時(shí)約2.0~2.5小時(shí),此步驟至為關(guān)鍵,若超過(guò)此階段,則轉(zhuǎn)化效率急劇下降。
(5)低溫操作的目的是使細(xì)胞不再生長(zhǎng),保持其感受態(tài)。
(6)此步驟的目的是洗滌細(xì)胞。
(7)此時(shí)細(xì)胞較脆,懸浮時(shí)動(dòng)作要輕,可用移液槍輕輕吸打。
(8)-70℃冰箱儲(chǔ)存的感受態(tài)細(xì)胞在6-8周后,轉(zhuǎn)化率很快降低??捎靡灰阎獦?biāo)準(zhǔn)及濃度的閉環(huán)質(zhì)粒如pUC18/19鑒定感受態(tài)細(xì)胞的轉(zhuǎn)化能力。
(9)實(shí)驗(yàn)中一定要設(shè)計(jì)正負(fù)對(duì)照,如用無(wú)DNA轉(zhuǎn)化物的感受態(tài)細(xì)菌鋪板,若有菌落生長(zhǎng),說(shuō)明其中抗生素濃度不夠或感受態(tài)細(xì)胞已被污染。加樣時(shí)速度要快,但要有條不紊,切勿加錯(cuò)!加完樣用槍尖稍攪勻。第1項(xiàng)中所加連接產(chǎn)物的量可根據(jù)連接反應(yīng)的終體積而定,一般加一半或2/3,其余置-20℃保存。
(10)從-80℃冰箱中取出冷凍的指管后,也可用雙手搓指管,利用掌心的溫度解凍。解凍時(shí)間勿過(guò)長(zhǎng)。
(11)至少30min,可延長(zhǎng)至1h左右。
(12)掌握時(shí)間,過(guò)長(zhǎng)會(huì)致死細(xì)胞。在許多實(shí)驗(yàn)方案中,熱激時(shí)間設(shè)為90至120秒,目前已有實(shí)驗(yàn)證明如此長(zhǎng)的熱激時(shí)間是沒(méi)有必要的,且會(huì)引起轉(zhuǎn)化效率的下降。熱激前加入相當(dāng)于轉(zhuǎn)化液體積1/10的DMSO可提高轉(zhuǎn)化效率10倍左右,加入DMSO后請(qǐng)勿再劇烈振蕩。
(13)此步驟使得細(xì)菌恢復(fù)正常并讓?duì)?內(nèi)酰氨酶基因表達(dá)。
(14)此步驟可在實(shí)驗(yàn)出現(xiàn)錯(cuò)誤后進(jìn)行補(bǔ)救。
(15)培養(yǎng)時(shí)間勿過(guò)長(zhǎng),以免衛(wèi)星菌落的出現(xiàn)。很多因素都可以影響轉(zhuǎn)化的效率,特別需要注意的有兩點(diǎn),一是制備感受態(tài)細(xì)胞時(shí)的OD值,二是所用試劑要分析純以上,并用雙蒸水或超純水(如MiliQ)配制。
【實(shí)驗(yàn)安排】
實(shí)驗(yàn)前兩天挑E.coli菌種在LB平板上劃線,37℃培養(yǎng)過(guò)夜。實(shí)驗(yàn)前一天各組要將試劑準(zhǔn)備好,包括培養(yǎng)基的消毒滅菌。下午臨下課時(shí)從平板上挑新鮮的單菌落接種到3mL液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)過(guò)夜。轉(zhuǎn)化完畢,次日一早觀察記錄結(jié)果,并清理余下的菌種試劑等。
【實(shí)驗(yàn)報(bào)告要求與思考題】
1.制備感受態(tài)細(xì)胞和轉(zhuǎn)化時(shí),應(yīng)特別注意哪些環(huán)節(jié)。
2.轉(zhuǎn)化效率的計(jì)算:轉(zhuǎn)化效率是指每微克質(zhì)粒DNA轉(zhuǎn)化細(xì)胞產(chǎn)生的轉(zhuǎn)化子數(shù)目,請(qǐng)列表表示你的轉(zhuǎn)化結(jié)果并算出轉(zhuǎn)化率(列出計(jì)算公式)。你所做實(shí)驗(yàn)的轉(zhuǎn)化效率(正對(duì)照)是多少?如果過(guò)低(如低于104cfu/μgDNA),請(qǐng)分析可能的原因。需要注意的是,連接產(chǎn)物的轉(zhuǎn)化效率是非常低的,為什么?
3.若實(shí)驗(yàn)出現(xiàn)不正常的結(jié)果,請(qǐng)分析原因。
附錄:大腸桿菌的高效轉(zhuǎn)化方法
一、試劑
TB溶液:1.512gPIPES,1.1025gCaCl2,9.31875gKCl,溶于水,以5NKOH調(diào)pH6.7,再加入5.44225gMnCl2,定容至500ml,0.22?m濾膜過(guò)濾滅菌,4℃保存。
SOB培養(yǎng)基:Tryptone20g(OXOID公司);Yeastextract5g(OXOID公司);NaCl0.5g,加800ml雙蒸水,加入250mmol/LKCl溶液10ml,用10mol/LNaOH調(diào)pH至7.0,定容至1,000ml,高壓滅菌,4℃保存;使用前加入5ml經(jīng)高壓滅菌的2mol/LMgCl2溶液。
SOC培養(yǎng)基:含20mmol/L葡萄糖的SOB培養(yǎng)基,SOB培養(yǎng)基高壓滅菌后,降溫至60℃或以下時(shí),加入20ml經(jīng)過(guò)濾除菌的1mmol/L葡萄糖溶液,4℃保存。
DMSO
二、方法
(一)感受態(tài)細(xì)胞的制備
1.將E.coliDH5α,涂布于LB(A-)培養(yǎng)基上,37℃過(guò)夜。
2.挑取2-3個(gè)直徑2-3mm的大菌落,接種到50mlSOB培養(yǎng)基中。在250ml三角瓶中18℃,200-250rpm振蕩培養(yǎng),直到OD=0.6,約需要36-48hr。
3.將三角瓶冰浴10分鐘。
4.轉(zhuǎn)移菌液到50ml離心管。2,500g,10min,4℃。
5.菌體用16ml冰預(yù)冷的TB溶液懸浮,冰浴10min。
6.2,500g,10min,4℃。
7.菌體用4ml冰預(yù)冷的TB溶液懸浮,加入280ulDMSO。
8.菌液于冰浴10分鐘后分裝到凍存管。每管200ul。液氮冷卻,保存于液氮中。大月0分鐘后,轉(zhuǎn)移到-40℃冰箱保存。
(二)轉(zhuǎn)化
1.將LB抗性平板,SOC培養(yǎng)基,于37℃預(yù)熱。
2.室溫溶解感受態(tài)細(xì)胞。
3.取200uL菌液加入1.5mL離心管中,放于冰中。
4.加入1-5uL質(zhì)粒溶液,用槍頭混勻,冰浴30min。
5.42℃熱激30秒,冰浴。
6.加入800uLSOC培養(yǎng)基,37℃,250r/min,1hr。
7.涂布LB抗性平板,37℃過(guò)夜。
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