FFPE樣本是指通過福爾馬林固定石蠟包埋（Formalin-Fixed, Paraffin-Embedded）技術(shù)處理和保存的生物組織樣本。這種方法能夠較長(zhǎng)時(shí)間地保存組織標(biāo)本，且便于運(yùn)輸，所以廣泛用于病理學(xué)、組織學(xué)和分子生物學(xué)研究，尤其是在癌癥和遺傳學(xué)研究中，是研究歷史樣本和臨床樣本的重要來源。

圖1. FFPE標(biāo)本

圖2. FFPE樣本應(yīng)用

FFPE組織切片是寶貴的生物醫(yī)學(xué)研究材料，被譽(yù)為病理科的“瑰寶”。它們蘊(yùn)藏著豐富的疾病信息，為臨床診斷和科學(xué)研究提供了重要的支持。然而，F(xiàn)FPE標(biāo)本的制作過程卻如同一把雙ren劍，既賦予了它許多優(yōu)勢(shì)，也帶來了某些挑戰(zhàn)。

圖3. FFPE樣本特點(diǎn)

從福爾馬林固定石蠟包埋（FFPE）樣本中提取臨床材料是一種常見且有效的方法。然而，固定和保存過程可能會(huì)對(duì)樣本中的核酸質(zhì)量造成損傷，影響其完整性。因此，想要從樣本獲得更多有用信息，包括高質(zhì)量的序列數(shù)據(jù)就變得具有挑戰(zhàn)性，尤其是當(dāng)樣本總量有xian時(shí)。翌圣推出的FFPE修復(fù)試劑（Hieff NGS® FFPE DNA Repair Reagent，Cat#12606ES），由多種酶按特定配方優(yōu)化混合而成，經(jīng)過驗(yàn)證，能夠有效修復(fù)FFPE樣本中的DNA。該修復(fù)試劑不僅能提高文庫(kù)產(chǎn)量，還具有無偏嗜性的特點(diǎn)，整體提升了建庫(kù)的成功率。

表1. FFPE修復(fù)試劑修復(fù)能力匯總

在文庫(kù)構(gòu)建過程中，設(shè)置兩組實(shí)驗(yàn)，針對(duì)相同樣本進(jìn)行比較。一組在末端修復(fù)加A步驟中添加修復(fù)試劑，另一組不添加修復(fù)試劑，同時(shí)進(jìn)行文庫(kù)構(gòu)建。實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示，F(xiàn)FPE修復(fù)試劑通過修復(fù)樣本顯著提高了低質(zhì)量FFPE樣本的文庫(kù)產(chǎn)出，而對(duì)高質(zhì)量FFPE樣本的文庫(kù)產(chǎn)量提升則不明顯。

圖4. FFPE修復(fù)試劑對(duì)建庫(kù)產(chǎn)量的影響

對(duì)修復(fù)試劑在4℃和25℃恒溫條件下進(jìn)行穩(wěn)定性測(cè)試。結(jié)果顯示，在4℃和25℃放置4周后，文庫(kù)產(chǎn)量與對(duì)照組相比基本無明顯下降趨勢(shì)。

圖5. FFPE修復(fù)試劑穩(wěn)定性測(cè)試文庫(kù)產(chǎn)量監(jiān)測(cè)圖

FFPE樣本承載著大量寶貴的臨床和科研數(shù)據(jù)。通過我們的FFPE樣本修復(fù)試劑，研究人員可以最大限度地挖掘這些樣本的潛能，將“沉睡”的數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為推動(dòng)醫(yī)學(xué)進(jìn)步的重要資源。

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