當(dāng)我們資源不足時，自然會想要找一些省錢的辦法來發(fā)文章，窮則思變嘛。生信是個好辦法，

可是有些醫(yī)生朋友還是覺得不太熟悉，別說后邊的分析方法了，就連開始找數(shù)據(jù)都不好找。

研究腫瘤的比較有福，腫瘤的數(shù)據(jù)zui豐富了，像大名鼎鼎的 TCGA、Ocomine 等?？裳芯科?/span>

他疾病的怎么辦，有沒有疾病特異性數(shù)據(jù)庫呢？

資源上哪找

隨著研究成果的積累，大大小小的數(shù)據(jù)庫們就冒了出來，駐扎在互聯(lián)網(wǎng)的各個角落，現(xiàn)在已

1218經(jīng)有了上千個。

找數(shù)據(jù)比較權(quán)wei的資源集中站，是牛津大學(xué)出版社的 Nucleic Acids Research（NAR）雜志。從

1994 年開始，NAR 每年都要出版分子生物學(xué)數(shù)據(jù)庫特輯（database issue），收錄新增的數(shù)據(jù)

庫、盤點舊數(shù)據(jù)庫的更新狀況、移除失效鏈接等，做個總結(jié)。目前版是第 24 版，即 2017 

版。

而所有收錄的數(shù)據(jù)庫可以在 NAR 的網(wǎng)站上找到，下面是一個按字母排序的列表

不過找起來更方便的可能是按功能分類查找：

NAR 把數(shù)據(jù)庫分為 15 個類別（有些數(shù)據(jù)庫會同時被分到好幾個類別）：

1219有些分類下邊還有子類別，可以跟據(jù)自己的目的逐級點開，找到相應(yīng)的資源。比如想找個特

定的疾病，就點開 Human Genes and Diseases，下邊還有 4 個子分類，其中癌癥基因數(shù)據(jù)庫

是單*個子類（Cancer gene databases），其他的疾病可以點開 Gene-, system- or disease

specific databases，就可看到具體數(shù)據(jù)庫列表。

1220這當(dāng)然只是一部分啦~

圖中可看到注意力缺陷多動障礙（ADHDgene），自身免疫性淋巴細(xì)胞增生綜合征（ALPSbase），

阿茲海默?。?/span>AlzGene）等等。

點進(jìn)去會有數(shù)據(jù)庫的描述說明，或詳或略。并附有數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站鏈接，點進(jìn)去就是了。

注意數(shù)據(jù)庫的質(zhì)量

數(shù)據(jù)庫這么多，也有大小之分，當(dāng)然不是隨便一個數(shù)據(jù)庫拿來就用，用了就能得到非常牢靠

的研究成果。

一個成功的數(shù)據(jù)庫背后，要有良好的管理維護(hù)工作。大數(shù)據(jù)庫為什么著名、好用，是因為有

一個大集團(tuán)在運營。比較著名的機構(gòu)有美國國家生物技術(shù)信息中心（NCBI）、歐洲分子生物

學(xué)實驗室-歐洲生物信息學(xué)研究所（EMBL-EBI）、瑞士生物信息學(xué)研究所（SIB）、日本國立遺

傳學(xué)研究所（NIG）、華大基因（BGI）等。

而一些小團(tuán)隊為自己特定的研究領(lǐng)域創(chuàng)建的數(shù)據(jù)庫，質(zhì)量就參差不齊了，上邊提到的疾病特

異性數(shù)據(jù)庫大多屬于此類。

1221雖然小團(tuán)隊不容易跟大佬競爭，而且有時候同一個領(lǐng)域會有好幾個相似的數(shù)據(jù)庫，NAR 也不

介意都收錄，只要它們符合一定質(zhì)量條件，且還在運營、維護(hù)、為研究者提供服。因為 NAR

鼓勵良性競爭，讓那些數(shù)據(jù)庫經(jīng)歷時間的考驗證明自己。像研究 G 蛋白耦聯(lián)受體的 GPCRdb

和研究碳水化合物活性酶的 CAZy 就是小團(tuán)隊的成功范例。

對于用戶來說，采用一個數(shù)據(jù)庫做研究之前要多留心，要了解好它的數(shù)據(jù)來源和運營維護(hù)情

況，是否有及時回應(yīng)用戶的反饋，是否有版本控制；還要多檢索文獻(xiàn)，看看這個數(shù)據(jù)庫的使

用情況，大家利用它做出了哪些成果，反饋如何等等。必要時可多找?guī)讉€相關(guān)的數(shù)據(jù)庫互相

佐證。