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技術(shù)文章

細(xì)胞遺傳學(xué)技術(shù)

點(diǎn)擊次數(shù):2045 發(fā)布時(shí)間:2008-1-17

細(xì)胞遺傳學(xué)技術(shù)

細(xì)胞遺傳學(xué)一詞可追溯到一百多年前科學(xué)家在細(xì)胞核里發(fā)現(xiàn)染色體的時(shí)候。 染色體"在希臘語里的意思是帶色的"。染色體顯帶技術(shù)的發(fā)展使科學(xué)家們能夠識別不同的染色體,從而在染色體水平上來了解許多疾病的遺傳變異。但是,細(xì)胞遺傳學(xué)研究也有它的不足之處。首先,受限于顯帶技術(shù)的分辨率(超過3MbDNA才能被識別),檢出象染色體微缺失綜合癥之類的微小染色體變異可能性很??;第二,傳統(tǒng)細(xì)胞遺傳技術(shù)只能分析中期分裂相細(xì)胞。而且,許多腫瘤特別是實(shí)體,染色體重組非常復(fù)雜,無法通過顯帶分析方法得到全部染色體核型。

熒光原位雜交技術(shù)(FISH)是二十世紀(jì)八十年代后期發(fā)展起來的,那時(shí)科學(xué)家們想用非放射性方法進(jìn)行基因定位(Pinkel D.et al.,1986)。FISH技術(shù)的發(fā)展很快在細(xì)胞遺傳學(xué)和分子遺傳學(xué)之間建立了一座橋梁。這是分子細(xì)胞遺傳學(xué)開始的標(biāo)志。這種方法被廣泛用于檢測染色體重組和標(biāo)記染色體(Pinkel D.et al.,1988),以及檢測許多基因疾病的染色體的微缺失(Kuwano A et al.,1991)和用于非整倍體疾病的產(chǎn)前診斷(Eastmond DA and Pinkel D,1989)。同時(shí),為了滿足更多的需求,通過流式細(xì)胞技術(shù),染色體微切割和人類基因組進(jìn)程計(jì)劃(HGP)等不同的技術(shù),產(chǎn)生了越來越多的FISH探針并被商品化。運(yùn)用這些探針,科學(xué)家們能夠識別染色體穩(wěn)定易位的斷裂點(diǎn)和繪制出與某些特異性疾病相關(guān)的關(guān)鍵缺失區(qū)域??寺∵@些區(qū)域就可以識別與基因相關(guān)的疾病,從而制造出用于診斷的特異性探針。

1998年以來,許多以FISH為基礎(chǔ)的技術(shù)發(fā)展起來,解決了許多傳統(tǒng)細(xì)胞遺傳學(xué)中存在的問題,并開辟了分子細(xì)胞遺傳學(xué)的新時(shí)代。

直到1996年,M-FISH技術(shù)才得以建立,也就是運(yùn)用幾種不同熒光染色將22對常染色體和2條性染色體著色染成24種不同的顏色組合(Schrock E,et al.,1996;Speicher MR,et al.,1996)。這項(xiàng)研究的原理是:將幾種熒光染料混合后所產(chǎn)生的顏色要多于所使用混合染料的數(shù)目。理論上,如果使用n種熒光染料,那么就可檢
測2n-1個(gè)目標(biāo)。因此,只用5種熒光染料就可標(biāo)記22對常染色體和2條性染色體。M-FISH就是使用這種方法來標(biāo)記探針,每條染色體被不同的熒光染料組合標(biāo)記。而且,這兩種技術(shù)也使用特殊的軟件來識別虛擬顏色代表的不同的熒光組合。M-FISH中,通過5個(gè)窄帶濾波器對5種不同的熒光圖像分別捕獲,然后對這5個(gè)圖像整合并用特定的軟件分析;

比較基因組雜交技術(shù),可以在一次實(shí)驗(yàn)中分析整個(gè)基因組的DNA序列拷貝的數(shù)目變化(Kallioniemi A,etal.,1992)。將等量的被檢測組織和正常對照組織全基因組DNA分別用綠色或紅色熒光標(biāo)記,混合變性后與標(biāo)記探針和正常的分裂中期染色體雜交,雜交后對照各自的參考染色體分別計(jì)算和分析檢測組織和正常對照組織的熒光比率。此項(xiàng)技術(shù)可以有效地檢測染色體不平衡,例如缺失、重復(fù)。CGH也有缺點(diǎn),首先,該技術(shù)只能檢測非平衡的染色體重組,對平衡染色體重組卻無能為力;大部分CGH軟件有自動核型分析軟件包系統(tǒng),但是需要一定程度的手動干預(yù)。另一個(gè)局限是分辨率低,一般只有大于10Mb的非平衡改變才能被檢測。對于高水平的擴(kuò)增,2Mb就可以被檢測。
盡管CGH可以用來分析組織樣本的細(xì)胞遺傳學(xué)變異,但由于分辨率低的關(guān)系,對于單個(gè)基因異常提供的信息有限。在這種情況下,間期FISH為檢測特定基因位點(diǎn)上的變異提供了選擇方法。因?yàn)槿旧|(zhì)在細(xì)胞核內(nèi)纏繞而難以變性。細(xì)胞分裂間期FISH的難度大于中期FISH。因此,間期FISH探針需信號強(qiáng)烈集且無背景信號產(chǎn)生,以避免判斷錯(cuò)誤。黏性質(zhì)粒,PACBAC可用于間期FISH,YAC則因?yàn)樗陌袇^(qū)域太大會產(chǎn)生成團(tuán)"信號而不適合使用。間期FISH廣泛應(yīng)用于臨床診斷中,尤其是對染色體核型分析失敗和遺傳學(xué)分析貌似正常的病例尤為有意義。

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