多年來，腫瘤專家根據(jù)每個患者腫瘤的DNA測序結果制定靶向治療方案。而近年來，研究發(fā)現(xiàn)，通過RNA測序也能為提供有效的關鍵信息，且在一些關鍵基因檢測上更具臨床意義。目前，歐洲的一個研究小組的研究證實，DNA測序的同時進行RNA的測序可以幫助臨床醫(yī)生以更快的速度、更低的成本進行更準確的癌癥診斷。
該研究項目覆蓋3000例晚期NSCLC腫瘤患者
該回顧性研究是迄今為止同類研究中大的，自2014年7月到2018年4月，對3000例晚期非小細胞肺癌（NSCLC）患者進行了DNA和RNA水平的分析。
據(jù)海德堡大學醫(yī)院（Heidelberg University Hospital）病理研究所分子病理學中心主任Albrecht Stenzinger博士介紹，與傳統(tǒng)的單基因測試相比，高通量測序（NGS）所需的組織樣本更少，速度更快，成本更低。Stenzinger博士主持了這項研究，該研究成果最近發(fā)表在國際癌癥雜志中（International Journal of Cancer）。
DNA測序+RNA測序優(yōu)勢顯著
Stenzinger博士與來自德國幾家研究機構的多學科臨床研究團隊開展合作研究。研究結果表明，同時進行DNA和RNA靶向測序，并依據(jù)其結果進行腫瘤的診斷，在多方面都優(yōu)于國際臨床診療指南的推薦。他們在研究中所使用的檢測和分析方法經過精心設計，有利于幫助腫瘤專家制定更多樣化的治療方案。
該團隊研究方案是基于Ion AmpliSeq技術所設計的，針對實體腫瘤進行分析，利用Ion Torrent測序平臺將周轉時間平均縮短到6個工作日（國際指南目前推薦10個工作日）。當腫瘤組織量不足時，會存在一定的組織丟棄率；在實驗優(yōu)化過程中，該研究的組織丟棄率從6.5%下降到3.4%，平均所需樣本量為10ng DNA和20ng RNA。
其研究目標是為盡可能多的患者獲取合適的診斷信息，NGS尤其是基于Ampliseq技術的NGS，集多種優(yōu)勢，讓研究者們更易于實現(xiàn)他們的目標。他們還強調了在常規(guī)臨床環(huán)境中，應用該方法在病人護理和臨床及轉化研究中的個體化治療有很好的可行性。
"RNA檢測至關重要！"——Stenzinger博士
海德堡大學醫(yī)院病理研究所分子病理學中心主任
Albrecht Stenzinger博士
Stenzinger博士說：
我們實驗研究證明了這種一站式的檢測方法，可以從少量的活檢組織中同時提取DNA和RNA，然后對它們進行測序，使我們不僅有機會了解DNA水平上的突變，還可以了解轉錄水平的基因融合。 舉個例子，我們不僅可以檢測到一個腫瘤存在ALK基因的易位，也可以檢測到因轉錄活躍而產生的ALK-ELM4融合。
雖然目前的指南建議通過熒光原位雜交實驗（FISH）來進行RNA分析，但Stenzinger博士的研究表明，在NSCLC治療中，一些已知的與預后和療效預測密切相關的基因融合，如采用RNA測序檢測，方法學上更優(yōu)更好?；蛉诤习l(fā)生于兩條染色體上DNA片段的移位；然而，只有轉錄成RNA的融合體才有可能被表達并可能導致癌癥。因此，該團隊的研究成果可以幫助醫(yī)生更有效地為患者確定積極的治療和監(jiān)測方案。 Stenzinger博士繼續(xù)說道：
你能立刻知道病人在基因水平發(fā)生了什么問題，以及確定其基因微環(huán)境是否在疾病進展中起到了真正的作用。我們知道TP53突變會影響ALK陽性NSCLC患者的療效和預后。舉例來說，ALK基因融合某一變體會導致非常低的生存率。 Stenzinger解釋道：
對DNA和RNA同時進行測序，可以為臨床醫(yī)生提供更多信息用于治療方案的選擇和制定。
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