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生物分子類實(shí)驗(yàn)室常用實(shí)驗(yàn)技術(shù)原理匯總-1
閱讀:595 發(fā)布時(shí)間:2014-12-8一、GST pull-down實(shí)驗(yàn)
基本原理:將靶蛋白-GST融合蛋白親和固化在谷胱甘肽親和樹脂上,作為與目的蛋白親和的支撐物,充當(dāng)一種“誘餌蛋白”,目的蛋白溶液過柱,可從中捕獲與之相互作用的“捕獲蛋白”(目的蛋白),洗脫結(jié)合物后通過SDS-PAGE電泳分析,從而證實(shí)兩種蛋白間的相互作用或篩選相應(yīng)的目的蛋白,“誘餌蛋白”和“捕獲蛋白”均可通過細(xì)胞裂解物、純化的蛋白、表達(dá)系統(tǒng)以及體外轉(zhuǎn)錄翻譯系統(tǒng)等方法獲得。此方法簡(jiǎn)單易行,操作方便。注:GST即谷胱甘肽巰基轉(zhuǎn)移酶(glutathione S-transferase)
二、足印法(Footprinting)
足印法(Footprinting)是一種用來測(cè)定DNA-蛋白質(zhì)專一性結(jié)合的方法,用于檢測(cè)目的DNA序列與特定蛋白質(zhì)的結(jié)合,也可展示蛋白質(zhì)因子同特定片段之間的結(jié)合。其原理為:DNA和蛋白質(zhì)結(jié)合后,DNA與蛋白的結(jié)合區(qū)域不能被DNase(脫氧核糖核酸酶)分解,在對(duì)目的DNA序列進(jìn)行檢測(cè)時(shí)便出現(xiàn)了一段無DNA序列的空白區(qū)(即蛋白質(zhì)結(jié)合區(qū)),從而了解與蛋白質(zhì)結(jié)合部位的核苷酸數(shù)目及其核苷酸序列。
三、染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)
染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)是研究體內(nèi)蛋白質(zhì)與DNA相互作用的有力工具,利用該技術(shù)不僅可以檢測(cè)體內(nèi)反式因子與DNA的動(dòng)態(tài)作用,還可以用來研究組蛋白的各種共價(jià)修飾以及轉(zhuǎn)錄因子與基因表達(dá)的關(guān)系。
染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù)的原理是:在生理狀態(tài)下把細(xì)胞內(nèi)的DNA與蛋白質(zhì)交聯(lián)在一起,通過超聲或酶處理將染色質(zhì)切為小片段后,利用抗原抗體的特異性識(shí)別 反應(yīng),將與目的蛋白相結(jié)合的片段沉淀下來。染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù)一般包括細(xì)胞固定,染色質(zhì)斷裂,染色質(zhì)免疫沉淀,交聯(lián)反應(yīng)的逆轉(zhuǎn),DNA的純化及鑒定。
四、基因芯片(又稱生物芯片)技術(shù)
基因芯片指將大量探針分子固定于支持物上后與標(biāo)記的樣品分子進(jìn)行雜交,通過檢測(cè)每個(gè)探針分子的雜交信號(hào)強(qiáng)度進(jìn)而獲取樣品分子的數(shù)量和序列信息。通俗地說,就是通過微加工技術(shù) ,將數(shù)以萬計(jì)、乃至百萬計(jì)的特定序列的片段(基因探針),有規(guī)律地排列固定于2cm2 的硅片、玻片等支持物上,構(gòu)成的一個(gè)二維DNA探針陣列,被稱為基因芯片?;蛐酒饕糜诨驒z測(cè)工作 。
基因芯片的測(cè)序原理是雜交測(cè)序方法,即通過與一組已知序列的核酸探針雜交進(jìn)行核酸序列測(cè)定的方法,在一塊基片表面固定了序列已知的八核苷酸的探針。當(dāng)溶液中帶有熒光標(biāo)記的核酸序列TATGCAATCTAG,與基因芯片上對(duì)應(yīng)位置的核酸探針產(chǎn)生互補(bǔ)匹配時(shí),通過確定熒光強(qiáng)度zui強(qiáng)的探針位置,獲得一組序列*互補(bǔ)的探針序列。據(jù)此可重組出靶核酸的序列。
五、液相色譜(HPLC)
液相色譜法是在經(jīng)典色譜法的基礎(chǔ)上,引用了氣相色譜的理論,在技術(shù)上,流動(dòng)相改為高壓輸送;色譜柱是以特殊的方法用小粒徑的填料填充而成,從而使柱效大大高于經(jīng)典液相色譜(每米塔板數(shù)可達(dá)幾萬或幾十萬);同時(shí)柱后連有高靈敏度的檢測(cè)器,可對(duì)流出物進(jìn)行連續(xù)檢測(cè)。
高壓泵將貯液罐的流動(dòng)相經(jīng)進(jìn)樣器送入色譜柱中,然后從檢測(cè)器的出口流出,這時(shí)整個(gè)系統(tǒng)就被流動(dòng)相充滿。當(dāng)欲分離樣品從進(jìn)樣器進(jìn)入時(shí),流經(jīng)進(jìn)樣器的流動(dòng)相將其帶入色譜柱中進(jìn)行分離,分離后不同組分依先后順序進(jìn)入檢測(cè)器,記錄儀將進(jìn)入檢測(cè)器的信號(hào)記錄下來,得到液相色譜圖。