CO2濃度探測可通過兩種控制系統(tǒng)――紅外傳感器（IR）或熱傳導傳感器（TC）進行測量。當二氧化碳培養(yǎng)箱的門被打開時，CO2從箱體內漏出，此時傳感器就會探測到CO2濃度的降低，并做出及時的反應，重新注入CO2使其恢復到原先預設的水平。熱傳導傳感器（TC）監(jiān)控CO2濃度的工作原理是通過測量兩個電熱調節(jié)器（一個調節(jié)器暴露于箱體環(huán)境內，另一個則是封閉的）之間的電阻變化來實現(xiàn)的。箱內CO2濃度的變化會改變兩個電熱調節(jié)器間的電阻，從而促使傳感器產生反應以達到調節(jié)CO2水平的作用。TC控制系統(tǒng)的一個缺點就是箱內溫度和相對濕度的改變會影響傳感器的穩(wěn)定度。當箱門被頻繁打開時，不僅CO2濃度，溫度和相對濕度也會發(fā)生很大的波動，因而影響了TC傳感器的精度。當需要的培養(yǎng)條件和頻繁開啟培養(yǎng)箱門時，此控制系統(tǒng)就顯得不太適用了。紅外傳感器（IR）作為另一個可選擇的控制系統(tǒng)比TC系統(tǒng)具備更穩(wěn)定的CO2控制能力，它是通過一個光學傳感器來檢測CO2水平的。IR系統(tǒng)包括一個紅外發(fā)射器和一個傳感器，當箱體內的CO2吸收了發(fā)射器發(fā)射的部分紅外線之后，傳感器就可以檢測出紅外線的減少量，而被吸收紅外線的量正好對應于箱體內CO2的水平，從而可以得出箱體內CO2的濃度。因為IR系統(tǒng)不會因溫度和相對濕度的改變而受到影響，所以它比TC系統(tǒng)更穩(wěn)定，適用于需要頻繁開啟培養(yǎng)箱門的細胞培養(yǎng)。然而，此系統(tǒng)比TC系統(tǒng)更貴，這時就要結合經費預算進行考慮了。
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