全自動顯微鏡操作菜單和所采集的圖像及顯微鏡功能控制同界面，即由軟件控制自動調焦、自動物鏡切換、自動功能轉換(明場、暗場、偏光、微分干涉相襯等觀察方法)、自動掃描載物臺、自動調光、自動采集圖像等。實現(xiàn)多個特征位置記憶，操作者可精確地對前幾次或幾十次的位置快速定位，可實現(xiàn)多視野的拼接和觀察，再根據實際需要靈活進行圖象處理分析等。脫機可電動、手動操作。計算機通過軟件自動控制顯微鏡動作的全自動系統(tǒng)，操作菜單和所采集的圖象及顯微鏡功能控制同界面，即由軟件控制自動調焦、自動物鏡切換、自動功能轉換(明場、暗場、偏光、微分干涉相襯等觀察方法)、自動掃描載物臺、自動調光、自動采集圖像等。實現(xiàn)多個特征位置記憶，操作者可精確地對前幾次或幾十次的位置快速定位可實現(xiàn)多視野的拼接和觀察，再根據實際需要靈活進行圖象處理分析等。
 

　　全自動顯微鏡廣泛應用于工業(yè)檢測、刑偵、生物科學、文物鑒定、藝術品移動備案等諸多方面，下面進行具體舉例分析：
 

　　(1)工部件的全自動探傷：在工業(yè)檢測現(xiàn)場，運用顯微鏡，通過設置，可對被檢測的工部件的全體和局部進行分別檢測，在電腦、高清電視等實時顯示探傷等微觀效果，在工部件研發(fā)、生產、質檢、售后等各部門得到廣泛應用，大大提高工業(yè)檢測質量和工作效率。
 

　　(2)刑偵物證全自動探尋：顯微鏡技術在刑偵中也得到普遍應用，將經過處理的紋痕、微小物證等運用顯微鏡，通過自動對焦，免去傳統(tǒng)顯微鏡繁瑣的操作過程，使工作人員可迅速的檢測出探尋的效果。
 

　　(3)生物生長全自動記錄：在科研單位、大學院校等生物研究單位，許多時候需要對觀察的生物的生長進行全程記錄，如果是運用傳統(tǒng)的生物顯微鏡的話，需要定時對所觀察的動、植物進行觀察、拍照記錄，而動、植物的生長又是個緩慢過程，研究人員很難做到規(guī)律、準確的記錄過程，而運用顯微鏡，通過具體的定時設置，即可全自動抓拍每個時間段的動、植物生長過程，大大節(jié)省了研究人員的精力和時間。
 

　　(4)文物鑒證全自動掃描：當前，我國收藏行業(yè)正積極推動藝術品鑒證質量溯源建設，是有效解決藝術品鑒定市場存在的“鑒定無標準、檢測無規(guī)則、執(zhí)業(yè)無資質”等亂象的重要舉措。而在藝術品鑒證環(huán)節(jié)，其中一個重要的步驟就是對需要備案的文物藝術品進行全影像、局部采點取證，運用顯微鏡可對需備案的文物藝術品進行自動、全覆蓋微觀掃描、取證，成為藝術品鑒證質量溯源建設必要工具。