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技術(shù)文章

Label-free-定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析服務(wù)

閱讀:1950          發(fā)布時間:2019-12-26

Label-free-定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析服務(wù)簡介:

與SILAC、iTRAQ/TMT等標記技術(shù)不同,Label-free不需要對蛋白質(zhì)樣品進行任何標記處理,只要將蛋白質(zhì)用trypsin酶解成肽段,進行LC-MS測試分析即可。label-free能保持樣品的“真實性”;

原則上,label-free能分析無限多個樣品,其通量要遠高于SILAC、iTRAQ/TMT等標記技術(shù),是真正的高通量蛋白質(zhì)分析技術(shù)。但是其也有本身的缺陷,即(1)對LC-MS的穩(wěn)定性要求*;(2)每個樣品至少要做3次技術(shù)重復(fù)或者生物學(xué)重復(fù);(3)定量準確度與SILAC、iTRAQ/TMT相比要差一些。

Label-free技術(shù)可用于高通量的biomarker篩選、蛋白質(zhì)相互作用、蛋白質(zhì)翻譯后修飾等方面的定量比較分析。

整體服務(wù)方案:

客戶只需提供樣本即可。我方負責完成后續(xù)所有實驗,包括:

蛋白質(zhì)提取與trypsin酶解。

每個樣品進行3次LC-MS重復(fù)測試。

MS文件定性、定量分析,篩選差異蛋白。

差異表達蛋白常規(guī)生物信息學(xué)分析。

參考文獻:

Cell, 2015. 163(3): 712-23.

Mol Cell Proteomics, 2015. 14(1): 120-35.

Mol Cell Proteomics, 2013. 12(7): 2006-20.

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