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在脂肪酶的作用下，脂肪水解成甘油和脂肪酸。甘油經(jīng)磷酸化和脫氫反應(yīng)，轉(zhuǎn)變成磷酸二羥丙酮，納入糖代謝途徑。脂肪酸與ATP和CoA在脂酰CoA合成酶的作用下，生成脂酰CoA。脂酰CoA在線粒體內(nèi)膜上肉毒堿：脂酰CoA轉(zhuǎn)移酶系統(tǒng)的幫助下進(jìn)入線粒體襯質(zhì)，經(jīng)β-氧化降解成乙酰CoA，在進(jìn)入三羧酸循環(huán)*氧化。β-氧化過程包括脫氫、水合、再脫氫和硫解四個(gè)步驟，每次β-氧化循環(huán)生成FADH2、NADH、乙酰CoA和比原先少兩個(gè)碳原子的脂酰CoA。此外，某些組織細(xì)胞中還存在α-氧化生成α羥脂肪酸或CO2和少一個(gè)碳原子的脂肪酸；經(jīng)ω-氧化生成相應(yīng)的二羧酸。

萌發(fā)的油料種子和某些微生物擁有乙醛酸循環(huán)途徑?？衫弥舅?/span>β-氧化生成的乙酰CoA合成蘋果酸，為糖異生和其它生物合成提供碳源。乙醛酸循環(huán)的兩個(gè)關(guān)鍵酶是異檸檬酸裂解酶和蘋果酸合成酶，前者催化異檸檬酸裂解成琥珀酸和乙醛酸，后者催化乙醛酸與乙酰CoA生成蘋果酸。