單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序是近年來生物學(xué)領(lǐng)域比較火的技術(shù)之一,憑借著其分辨率能夠精準(zhǔn)的剖析樣本細(xì)胞組成信息。隨著細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的發(fā)展,在多個應(yīng)用領(lǐng)域都有巨大的應(yīng)用潛力??傮w來說,目前細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的應(yīng)用主要有:
腫瘤具有很強(qiáng)的異質(zhì)性,這種異質(zhì)性對于腫瘤的疾病進(jìn)展和藥物療效都有至關(guān)重要的影響。了解腫瘤微環(huán)境及免疫微環(huán)境的組成有助于我們對腫瘤更清晰的了解,從而發(fā)現(xiàn)潛在的治療靶點(diǎn)。目前,單細(xì)胞測序已廣泛應(yīng)用于腫瘤微環(huán)境的研究中。
該研究繪制了從非萎縮性胃炎-萎縮性胃炎-腸上皮化生-早期胃癌患者胃黏膜的單細(xì)胞圖譜,研究發(fā)現(xiàn)從胃炎到胃癌過程中上皮細(xì)胞的變化發(fā)現(xiàn)胃高分化細(xì)胞類型的比例逐步下降,且在腸上皮化生時期出現(xiàn)干細(xì)胞樣細(xì)胞,早期胃癌病變中達(dá)到高值,為胃癌早期病變發(fā)現(xiàn)了可能的細(xì)胞標(biāo)志物。
在該肺癌研究中,作者對靶向治療前腫瘤樣本、靶向治療響應(yīng)后殘留的腫瘤樣本和靶向治療復(fù)發(fā)耐藥樣本進(jìn)行了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序,通過對比不同時期樣本特性,發(fā)現(xiàn)了潛在耐藥途徑,揭示了肺癌靶向治療的耐藥機(jī)制,并提供了潛在的治療靶點(diǎn)。
通過對免疫治療前后的黑色素瘤患者樣本進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序,并把治療后患者分為耐藥人群和不耐藥人群,通過對比發(fā)現(xiàn)在耐藥患者中,T細(xì)胞浸潤變低,且耐藥組CDK4/6信號通路異?;钴S,通過在黑色素瘤小鼠模型中利用CDK4/6抑制劑聯(lián)合免疫治療腫瘤明顯得到抑制。