單細(xì)胞分離可以采用特制的毛細(xì)管在載玻片的瓊脂涂層上選取單孢子并切割下來，然后移到合適的培養(yǎng)基進(jìn)行培養(yǎng)，分離法對(duì)操作技術(shù)有比較高的要求，多限于高度專業(yè)化的科學(xué)研究中采用。
它不僅僅可以用于分離單細(xì)胞，還可以用于nl級(jí)別試劑的分配和磁珠的分選，對(duì)于單細(xì)胞測(cè)序領(lǐng)域有著很大的幫助。快速高效接種單個(gè)活細(xì)胞至微孔板細(xì)胞分離系統(tǒng)的主要功能為高效柔和地分離或分選活的單細(xì)胞，該系統(tǒng)通過微流控技術(shù)柔和地形成細(xì)胞液滴，同時(shí)利用白光和熒光成像實(shí)時(shí)分析細(xì)胞數(shù)量和熒光強(qiáng)度。
該系統(tǒng)通過微流控技術(shù)柔和地形成細(xì)胞液滴，同時(shí)利用白光和熒光成像實(shí)時(shí)分析細(xì)胞數(shù)量和熒光強(qiáng)度，將符合要求的單細(xì)胞液滴準(zhǔn)確接種至96孔板或384孔板等微孔板中，分離過程中避免液體剪切力、電壓、超聲等影響，以維持高細(xì)胞活率，減少對(duì)細(xì)胞的脅迫壓力，便于后續(xù)培養(yǎng)或分析，主要應(yīng)用包括細(xì)胞株開發(fā)、稀有細(xì)胞分離、單細(xì)胞基因組測(cè)序和單細(xì)胞RNA測(cè)序等。
細(xì)胞分離可代替?zhèn)鹘y(tǒng)的有限稀釋法，高效地將單個(gè)活細(xì)胞接種至微孔板中，得益于分離系統(tǒng)的高效率和高活率，可以將每塊微孔板中可獲得的單克隆細(xì)胞團(tuán)提高至8塊，從而在相同的工作量下可篩選更多的細(xì)胞克隆，從中發(fā)現(xiàn)更多更優(yōu)質(zhì)的細(xì)胞株。單細(xì)胞分離過程中記錄的連續(xù)5張圖像，可以與后續(xù)的孔板成像的圖像證據(jù)互相補(bǔ)充，從而提高單克隆性的可信度。
