單細(xì)胞分析研究細(xì)胞異質(zhì)性的關(guān)鍵就在于能否實現(xiàn)對單個細(xì)胞進行較多參數(shù)的分析，這就是“單細(xì)胞分析”的概念。事實上，自從“細(xì)胞”學(xué)說被提出后，人類一直在努力尋求分析單個細(xì)胞的技術(shù)方法。

   但是，單細(xì)胞分析有一個巨大的挑戰(zhàn)，那就是樣品量及其有限，一個典型的人類細(xì)胞僅含有約6.6pg DNA、10pg總RNA，從如此有限的樣品中獲取大量的數(shù)據(jù)無疑是一個巨大的挑戰(zhàn)。所以，傳統(tǒng)的高通量分析手段  例如基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組學(xué)等，往往只能基于大量細(xì)胞進行分析，得到的也是大量細(xì)胞的平均信息；而一些可以針對單細(xì)胞進行分析的方法，例如免疫熒光、流式細(xì)胞術(shù)等，也會受到通道的限制，僅僅對少數(shù)  幾種蛋白進行分析，同樣無法深入分析其異質(zhì)性。

   直到近幾年，隨著相關(guān)領(lǐng)域的一系列技術(shù)突破，“單細(xì)胞分析”的概念才真正得以實現(xiàn)。兩類技術(shù)在這過程中起到了先導(dǎo)作用，首先是測序技術(shù)的進步，第二代測序技術(shù)大大降低了測序成本，使在一個實驗中對多個  樣本測序成為可能；其次，一些可以用于單細(xì)胞核酸樣本的擴增技術(shù)（例如MDA擴增基因組，SMART、TargetAmp可以擴增轉(zhuǎn)錄組）的開發(fā)，解決了單細(xì)胞核酸樣品量少的問題。

   轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)是近年來在醫(yī)學(xué)健康領(lǐng)域出現(xiàn)的新概念，目的是為了縮短基礎(chǔ)與臨床之間的距離，促進基礎(chǔ)研究和臨床研究成果的相互轉(zhuǎn)化，在轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)的研究中有著*的優(yōu)勢，這是由于臨床樣本具有其特殊性決定的。

   臨床樣本也存在很大的異質(zhì)性，只有單細(xì)胞分析才能有效揭示這種異質(zhì)性；很多臨床樣本量及其有限，情況下甚至只有一個細(xì)胞可供檢測，單細(xì)胞檢測是可行的方法；臨床樣本都是來自人的樣本，和實驗動  物不同，對于人所能用的研究方法受到很大限制，因此要求我們在有限的樣本中盡量多的獲取數(shù)據(jù)，而多參數(shù)單細(xì)胞分析恰恰滿足了這種需要。

   單細(xì)胞分析已經(jīng)漸漸滲透轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)的諸多相關(guān)領(lǐng)域，隨著相關(guān)技術(shù)的不斷進步和普及，它將繼續(xù)推動基礎(chǔ)研究和臨床研究協(xié)同發(fā)展。從某種意義上說，在未來人類的健康將很大程度上取決與我們對于自身細(xì)胞的了解  程度，因為，細(xì)胞是構(gòu)成生命基本單元，一切問題的根本都將歸結(jié)于細(xì)胞本身。