詳細(xì)介紹
(無縫克隆試劑盒)是一種新型的基于插入片段和線性化載體的末端進(jìn)行同源重組的基因克隆試劑盒。本試劑盒利用包含了DNA 5' 外切酶(5' Exonuclease)、DNA聚合酶(DNA Polymerase)和DNA連接酶(DNA
Ligase)活性的重組酶(assembly enzyme),通過同源重組的方法可以將一個或多個DN段按照預(yù)定方向、快速、高效和精確
地插入到線性化載體中,并且zui終構(gòu)建的克隆沒有任何額外的堿基序列,因此被稱作“無縫克隆”。
和傳統(tǒng)的基因克隆方法相比,本試劑盒的無縫克隆方法有多方面的突出優(yōu)點(diǎn):(1) zui終構(gòu)建的克隆沒有任何額外的堿基序列,因此是真正的"無縫克隆";(2) 可通過一個反應(yīng)將一個或多個片段快速、定向地插入到載體的任何位置;(3) 待插入的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物無須酶切;(4) 插入片段的大小范圍寬,從20bp左右的小片段到10kb左右的大片段都可以成功插入;(5) 可通過PCR擴(kuò)增獲得線性化載體,因此限制性內(nèi)切酶消化并不是克隆所必須的;(6) 酶催化的重組連接反應(yīng)非??焖俸透咝?,對于一個片段的插入僅需50℃處理15分鐘;對于三個片段的插入僅需50℃處理30分鐘,而對于5個片段的插入也僅需50℃處理約60分鐘;(7) 只有插入片段和線性化載體的末端才能發(fā)生同源重組,可以有效避免非特異性的同源重組;(8) 陽性克隆比例高,單個DNA片段克隆的陽性率幾乎為100%,三個片段的克隆陽性率約為70-80%。
本無縫克隆試劑盒操作非常簡單。本試劑盒進(jìn)行基因克隆時沒有酶切位點(diǎn)的限制,僅需在載體的預(yù)定克隆位點(diǎn)通過酶切進(jìn)行線性化或通過PCR的方法直接制備線性化的載體,在插入片段的兩個PCR引物的5' 端引入與載體克隆位點(diǎn)兩端**的
15~25bp的重疊序列。重組反應(yīng)可以在50℃快速進(jìn)行,3-4小時內(nèi)即可完成從DNA樣品的PCR擴(kuò)增、純化、重組、到轉(zhuǎn)化涂板的全部操作。其中PCR反應(yīng)約2-3小時,PCR產(chǎn)物純化約20分鐘,重組反應(yīng)15分鐘,轉(zhuǎn)化涂板約40分鐘,共計約3-4小時即可完成。
的工作原理示意圖請參考圖1。
圖1. 的工作原理圖。重疊區(qū)域(overlap region)的DNA序列**,通常長度為15-25bp。不同顏
色的重疊區(qū)域代表不同的重疊序列。在插入2個或以上片段時,不同的重疊序列可以確保待插入片段有序地插入到線性化的載體(linearized vector)中。
本試劑盒用于一個1100bp片段的克隆和三個不同的1100bp片段的克隆,其重組反應(yīng)產(chǎn)物轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)細(xì)胞后涂板獲得的LB平板的實測效果參考圖2A,菌落PCR鑒定結(jié)果參考圖2B。
圖2. 本試劑盒用于無縫克隆的實測效果。A. 本試劑盒反應(yīng)產(chǎn)物轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)菌DH5α后涂板獲得的LB平板效果圖。在20μl反應(yīng)體系中,將雙酶切線性化的載體pUC18 (Linearized pUC18),與通過PCR擴(kuò)增的含有重疊序列的插入片段(DNA fragment, 1100bp)混合(pUC18載體與PCR片段的摩爾比為1:3);或者與3個有適當(dāng)重疊序列的不同的1100bp片段混合,pUC18載體與PCR片段的摩爾比為1:1:1:1,然后加入10μl的2X Seamless Cloning Mix,并用水補(bǔ)至20μl,50℃反應(yīng)15min(插入一個片段)或
30min(插入三個片段)。反應(yīng)結(jié)束后,將反應(yīng)產(chǎn)物放置在冰上5min,取5μl轉(zhuǎn)化到100μl的DH5α感受態(tài)細(xì)菌中。對照組中只加入線性化的載體pUC18,同時也在50℃反應(yīng)15min。實驗結(jié)果表明,插入片段數(shù)目越多轉(zhuǎn)化后得到的克隆數(shù)越少。B.菌落PCR鑒定用本試劑盒構(gòu)建得到的克隆。實驗結(jié)果表明,插入1個片段時的陽性率基本上為100%,插入3個片段時的陽性率約為70%左右。
包裝清單:
產(chǎn)品編號 | 產(chǎn)品名稱 | 包裝 |
D7010FT-1 | 2X Seamless Cloning Mix | 50μl |
D7010FT-2 | Linearized pUC18 (50ng/μl) | 3μl |
D7010FT-3 | DNA fragment (1100bp, 60ng/μl) | 3μl |
D7010FT-4 | Nuclease free water | 50μl |
— | 說明書 | 1份 |
保存條件:
-20℃保存,一年有效。
注意事項:
單個片段的PCR產(chǎn)物進(jìn)行重組反應(yīng)時,如果PCR條帶單一,可以無須純化并直接進(jìn)行重組反應(yīng),但PCR產(chǎn)物的體積不得超過重組反應(yīng)體系的20%,并且重組效率通常會低于純化后的PCR產(chǎn)物。
對于多個片段的重組反應(yīng),重組效率通常會低于單個片段的重組效率,建議膠回收純化后再進(jìn)行重組反應(yīng)。對于3個以上片段的重組反應(yīng)或重組片段大于5kb時,強(qiáng)烈建議在膠回收后再進(jìn)行重組反應(yīng)。通常膠回收后,重組效率可提高2-10倍。
單片段和線性化載體重組時,摩爾比至少為2:1。多片段和線性化載體重組時,各個片段和線性化載體的摩爾數(shù)宜保持*。
本產(chǎn)品僅限于專業(yè)人員的科學(xué)研究用,不得用于臨床診斷或治療,不得用于食品或藥品,不得存放于普通住宅內(nèi)。
為了您的安全和健康,請穿實驗服并戴一次性手套操作。