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今天我們就來聊聊活細胞的DNA染色~

時間:2019/4/30閱讀:4078
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目前,在活細胞的DNA染色中,有兩組染料。組是Hoechst系列,它們具有細胞滲透性和熒光性(即低熒光直到結(jié)合靶DNA),但由于340-360nm范圍內(nèi)短紫外-藍色波長激發(fā)的要求,它們具有相當?shù)?/span>毒性。

第二組活細胞染料由遠紅外染料組成,如SiR-DNA™、Syto61™、Draq5™或Vybrant®Dyecycle™Ruby。這些染料克服了前一組光譜范圍的限制,允許使用波長約為650nm、發(fā)射波長約為700nm的低能激發(fā)光。這種光具有小的光毒性(SiR-Tubulin™和SiR-Actin™)并且細胞或組織樣品在該光譜范圍內(nèi)不吸收光也不自發(fā)熒光,這使得在厚樣本中有更深處成像成為可能。 

SiR-DNA™(SiR–Hoechst)是基于熒光團硅羅丹明(SiR)和DNA小槽粘合劑雙苯甲酰亞胺(Hoechst)組合而成,它比遠紅外染料組其他染料更具優(yōu)勢。

SiR–Hoechst(SiR-DNA™) 和其他遠紅外DNA染料長時間活細胞成像對比圖,顯示SiR–Hoechst的低毒性及熒光穩(wěn)定性

市面上幾種常見DNA染料對比 

特性
 

SiR-DNA™
 

其他遠紅外染料
Syto61™、Draq5™或Vybrant®Dyecycle™
 

短波長染料

Hoechst™

DAPI、EB

 細胞毒性

8小時內(nèi)持續(xù)使用對細胞無影響

廠家建議使用的濃度下對細胞顯示出強烈的毒性作用(細胞停止分裂或死亡)

適用于活細胞,但細胞毒性高,

不適于活細胞,且EB致使細胞突變

細胞滲透性

有細胞滲透性

有細胞滲透性

有細胞滲透性

無細胞滲透性

特異性

針對于活細胞DNA,特異性非常好

Syto61™、Draq5™或Vybrant®Dyecycle™染料在活細胞的DNA以外的其他結(jié)構(gòu)上產(chǎn)生強烈的非特異性信號

很高的吸收率和自發(fā)熒光,背景較高

超分辨率顯微鏡兼容性

在多次暴露于激發(fā)光下信號仍然很強

Syto61與超分辨顯微鏡兼容,但其高背景熒光和細胞毒性

不適合超分辨率分析

注:SiR-DNA™是Spirochrome SA公司的商標 (瑞士)

Vybrant® DyeCycle™ Ruby stain 和Syto61™是美國Thermo Fisher Scientific公司的商標

DRAQ5™是Biostatus公司商標

Hoechst™是美國Sanofi公司商標

 

SiR-DNA™的主要發(fā)展方向是將熒光特性、高DNA特異性、低毒性遠紅外激發(fā)/發(fā)射范圍相結(jié)合。此外,由于其穩(wěn)定性和對遠紅光的特性,探針在超分辨顯微鏡(STDE和SIM)中表現(xiàn)非常好。因此,SiR-DNA™是一種優(yōu)良的探針,其性能與SiR-tubulin和SiR-actin一樣。

在顯微鏡觀察和高通量篩選過程中,SiR-DNA™可以在不受紫外線刺激的情況下進行簡單的核復染。在流式細胞術(shù)過程中,SiR-DNA™可以直接用于血液/BM的表型分析和細胞DNA含量分析,而無需紅細胞溶解或固定、滲透或RNase處理等步驟。 

說了這么多,您有沒有對SiR-DNA™活細胞染料很心動了?作為專業(yè)的生命科學解決方案供應商,艾美捷科技為您推薦的活細胞DNA染色試劑盒: 

產(chǎn)品名稱

Ex/Em

濾光鏡

貨號

SiR-DNA Kit

652/672nm

標準Cy5設(shè)置

 CY-SC007

* 試劑盒均內(nèi)含Verapamil(維拉帕米,戊脈安),一種廣譜的外排泵抑制劑。

廠家質(zhì)檢:

常見問題整理:

是否兼容固定細胞?

SiR-DNA™可以與甲醇或PFA固定的細胞一起使用。然而,介質(zhì)對SiR-DNA™的亮度有很大的影響。當混有PBS或Vectashield®的細胞產(chǎn)生很低的信號,混合有純甘油的細胞會染出非常明亮的細胞核。因此,我們建議在用SiR-DNA™染色固定細胞時使用純甘油作為介質(zhì)。

哪些物種的樣本和組織能被SiR探針染色?

下方僅引述已報告起作用的細胞系、組織或生物體。

智人:U2OS,成纖維細胞,HeLa,HUVEC, MCF-10A, HCT-116, A549,紅細胞

肌肉:C2C12,IA32,骨骼肌,原代心肌細胞,原代卵母細胞

褐家鼠:初級海馬神經(jīng)元、初級皮質(zhì)神經(jīng)元、NRK

風信子:COS-7

金鯽:BHK

黑腹果蠅:Notum上皮,S2

迪德爾菲斯有袋動物:OK細胞

為什么SiR探針的背景比其他熒光團低?

SiR探針使用的是近紅外/遠紅外光譜范圍內(nèi)的激發(fā)光,從而避免較短波長的光產(chǎn)生自發(fā)熒光,從而避免產(chǎn)生較高的背景。SiR耦合探針具有兩種物理狀態(tài):①非熒光,關(guān)閉狀態(tài)(spirolactone)和②高熒光,開啟狀態(tài)(zwitterion)。探針與其配體目標的結(jié)合有利于高熒光的開放狀態(tài),而未結(jié)合探針則存在于封閉、非熒光狀態(tài)(下圖)。從未結(jié)合態(tài)到結(jié)合態(tài)熒光放大率增加100倍。這就產(chǎn)生了一種高度敏感的生物傳感器,其中大部分熒光只發(fā)生在結(jié)合態(tài)。

SiR衍生物在熒光(開放)型(左結(jié)構(gòu))和非熒光(封閉)型(右結(jié)構(gòu))之間存在平衡

Nature Communication專屬產(chǎn)品文章精彩了解:

G. Lukinavicius et al.,SiR–Hoechst is a far-red DNA stain for live-cell nanoscopy, Nat. Commun. 6:8497 doi: 10.1038/ncomms9497 (2015).

不同類型細胞DNA成像圖,4μm SiR–Hoechst

SiR-Hoechst染色HeLa細胞的共聚焦(confocal)和電鏡(STED)對比

SiR-Hoechst染色HeLa細胞的共聚焦(confocal)和電鏡(STED)對比

Cytoskeleton公司成立于1993年,專注于生物化學和細胞過程研究中的純化蛋白和便捷試劑盒開發(fā)與生產(chǎn)。公司提供藥物篩選、信號轉(zhuǎn)導、蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)錄后修飾(PTM)、細胞骨架研究相關(guān)的系列試劑盒和產(chǎn)品,尤其以細胞骨架相關(guān)研究見長,既能滿足于樣品較少的科學研究,也可以用于小規(guī)模篩選研究和高通量大規(guī)模篩選研究。

目前主要的產(chǎn)品有340余種,其產(chǎn)品主要覆蓋肌動蛋白,微管蛋白,馬達蛋白,小G蛋白,細胞外基質(zhì),活細胞成像等相關(guān)領(lǐng)域,提供對應的蛋白質(zhì),抗體,檢測與分析試劑盒,并且產(chǎn)品線還在不斷的擴大中。此外,公司還提供微管蛋白,肌動蛋白,小G蛋白,GAPs,GEFs等現(xiàn)有產(chǎn)品的藥物篩選服務。

 

 

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