近日,由中國科學(xué)院科技服務(wù)網(wǎng)絡(luò)計劃(STS計劃)項目支持,中科院青島生物能源與過程研究所、北京生命科學(xué)研究院、天津工業(yè)生物技術(shù)研究所、微生物研究所共同承擔(dān)的“生物高通量檢測分析服務(wù)網(wǎng)絡(luò)”項目結(jié)題驗收。
經(jīng)過5年的實施,該項目研制出了單細(xì)胞拉曼分選儀工程化樣機(RACS-Mini),開發(fā)了單細(xì)胞拉曼表型組數(shù)據(jù)庫及拉曼組數(shù)據(jù)分析軟件,建立了完整的單細(xì)胞拉曼成像-分選-測序的單細(xì)胞組學(xué)分析平臺,形成了外套基于拉曼光譜的高通量單細(xì)胞檢測、分析、分選系統(tǒng),為生命科學(xué)研究提供新工具。RACS-Mini適用于細(xì)菌、真菌、微藻、植物細(xì)胞、人體細(xì)胞等多種細(xì)胞類型,可實現(xiàn)無損、非標(biāo)記條件下每小時10萬個單細(xì)胞檢測通量,準(zhǔn)確率達(dá)到98.3%,分選后細(xì)胞超過93%細(xì)胞保持活性并可增殖。
中科院科技促進(jìn)發(fā)展局組織召開了該項目驗收會,驗收專家一致認(rèn)為該項目不僅在核心檢測裝備與技術(shù)方面有顯著創(chuàng)新,同時項目組利用所開發(fā)的設(shè)備及技術(shù),為外多個單位提供技術(shù)服務(wù),產(chǎn)生了積極的行業(yè)影響和可觀的經(jīng)濟效益,建議項目組應(yīng)進(jìn)一步發(fā)揮團隊力量,聚焦技術(shù)產(chǎn)業(yè)化推廣,促成更大的應(yīng)用成果,提升科技服務(wù)能力。
高通量測序的*性體現(xiàn)在:測序序列長,可以覆蓋16S /18S rDNA、ITS等高變區(qū)域; 測序通量高,可以檢測到環(huán)境樣品中的痕量微生物;實驗操作簡單、結(jié)果穩(wěn)定,可重復(fù)性強;無需進(jìn)行復(fù)雜的文庫構(gòu)建,微生物DNA擴增產(chǎn)物可以直接進(jìn)行測序,實驗周期短;測序數(shù)據(jù)便于進(jìn)行生物信息分析。
該方法得到*期刊的認(rèn)可(Nature等),已成為土壤微生物多樣性檢測的重要手段。上海美吉生物公司已有若干成功案例,為客戶提供的土壤樣本進(jìn)行高通量測序并進(jìn)行生物信息學(xué)分析。高通量測序因其數(shù)據(jù)量大,操作過程簡單,盡可能避免了繁瑣的實驗操作過程所造成的樣本損失,能夠相對客觀的反應(yīng)出土壤樣本的情況。
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