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轉(zhuǎn)化細(xì)胞命運(yùn)調(diào)控的認(rèn)識
閱讀:314 發(fā)布時(shí)間:2018-6-7轉(zhuǎn)化細(xì)胞處于某一特定狀態(tài)時(shí),它會選擇性閱讀與該細(xì)胞相關(guān)的所有信息,同時(shí)要屏蔽其它不需要的信息。將體細(xì)胞誘導(dǎo)為多能干細(xì)胞(俗稱的“細(xì)胞水平返老還童”)是探索這種機(jī)理的理想體系。成纖維細(xì)胞在導(dǎo)入誘導(dǎo)因子后,會啟動一套奇妙的未知程序,將體細(xì)胞返老還童到受精后約3-5天的狀態(tài)。過去10年來,*的科學(xué)家都在研究這一奇妙的過程,得到的成果極大地豐富了人類對細(xì)胞命運(yùn)調(diào)控的認(rèn)識。但目前對這一過程的了解主要以觀察變化的現(xiàn)象為主,并沒有從中抽象出具有普遍性邏輯或者規(guī)律。在該研究中,科研人員采用ATAC-seq技術(shù)讀取染色質(zhì)“開”與“關(guān)”的狀態(tài)。通過測定體細(xì)胞向多能干細(xì)胞轉(zhuǎn)變過程中每個(gè)染色質(zhì)位點(diǎn)的開放程度,定義出全基因組每個(gè)位點(diǎn)由關(guān)到開(close to open)和開到關(guān)(open to close)的全息動態(tài)過程,這些數(shù)據(jù)證實(shí)了一個(gè)相對簡單、普遍性的CO/OC邏輯體系。
研究發(fā)現(xiàn),在轉(zhuǎn)變過程中,早期成纖維細(xì)胞的很多特異性開放位點(diǎn)會被迅速關(guān)閉(OC),而到重編程后期很多多能性相關(guān)的位點(diǎn)則會被打開(CO)??蒲袌F(tuán)隊(duì)認(rèn)為開關(guān)的事件是直接與轉(zhuǎn)錄因子活性相關(guān),因此對CO/OC位點(diǎn)的基序(motif)進(jìn)行深入分析。分析發(fā)現(xiàn),CO位點(diǎn)顯著的富集出了重編程因子OCT、SOX、KLF的基序(motif),這與使用的重編程因子Oct4/Sox2/Klf4是吻合的,但CO的過程是非常緩慢的。在更加快速的OC過程中,在OC位點(diǎn)上特異富集出了很強(qiáng)的成纖維細(xì)胞特異性的轉(zhuǎn)錄因子,例如AP-1,ETS,TEAD,RUNX等家族成員,而沒有OCT等重編程因子,證明體細(xì)胞相關(guān)染色質(zhì)關(guān)閉(OC)過程是OCT、SOX、KLF非依賴的過程。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),與染色質(zhì)關(guān)閉(OC)過程相關(guān)的因子都是體細(xì)胞重編程的重要障礙。那么,關(guān)閉這些位點(diǎn)的OC過程優(yōu)勢如何在操作呢?通過進(jìn)一步篩選,研究發(fā)現(xiàn),表觀修飾基因Sap30在體細(xì)胞重編程早期被重編程因子激活,并通過促進(jìn)成纖維細(xì)胞關(guān)鍵基因啟動子區(qū)去乙?;揎?,而使其啟動子區(qū)逐漸關(guān)閉,zui終沉默成纖維細(xì)胞關(guān)鍵調(diào)控基因,推動重編程進(jìn)程。這部分研究結(jié)果揭示體轉(zhuǎn)化細(xì)胞重編程過程中染色質(zhì)結(jié)構(gòu)動態(tài)變化的規(guī)律—CO/OC邏輯,并為理解體細(xì)胞重編和其他相關(guān)細(xì)胞命運(yùn)轉(zhuǎn)變提供了新的可參考的理論模型。
5 x 10^5 cells/vial 人羊膜間充質(zhì)基質(zhì)細(xì)胞 HAMSC
5 x 10^5 cells/vial 人絨毛膜間充質(zhì)基質(zhì)細(xì)胞 HCMSC
1 x 10^6 cells/vial 人脂肪微血管內(nèi)皮細(xì)胞 HAMEC
1 x 10^6 cells/vial 人前脂肪細(xì)胞-內(nèi)臟 HPA-v
1 x 10^6 cells/vial 人前脂肪細(xì)胞-皮下 HPA-s
5 x 10^5 cells/vial 人卵巢微血管內(nèi)皮細(xì)胞 HOMEC
5 x 10^5 cells/vial 人卵巢表層上皮細(xì)胞 HOSEpiC
5 x 10^5 cells/vial 人卵巢成纖維細(xì)胞 HOF
5 x 10^5 cells/vial 人羊膜間充質(zhì)基質(zhì)細(xì)胞 HAMSC
5 x 10^5 cells/vial 人絨毛膜間充質(zhì)基質(zhì)細(xì)胞 HCMSC
5 x 10^5 cells/vial 人骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞 HMSC-bm
5 x 10^5 cells/vial 人脂肪間充質(zhì)干細(xì)胞 HMSC-ad
5 x 10^5 cells/vial 人肝臟間充質(zhì)干細(xì)胞 HMSC-hp
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