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[供應]R400490 R400491 R400492-Rubicon Genomics ThruPLEX Plasma-seq NGS

貨物所在地:上海上海市
更新時間:2024-12-25 17:12:30
有效期:2024年12月25日 -- 2025年6月26日
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產品簡介
Rubicon Genomics ThruPLEX Plasma-seq NGS
ThruPLEX® Plasma-seq基于ThruPLEX技術,并用于血漿來源cfDNA高品質NGS文庫構建。
該試劑專門針對cfDNA進行優(yōu)化,在保持樣本GC代表性的基礎上,提升了文庫的信息容量。文庫構建后可用于CNV分析、全基因組測序分析或是采用一些panel針對目標區(qū)域進行捕獲富集后的DNA分析
詳細介紹

歡迎您致電 華雅再生醫(yī)學旗艦公司:紅榮微再(上海)生物工程技術有限公司 181 6644 1624。紅榮微再-客服 1022 355 724  

Rubicon Genomics ThruPLEX Plasma-seq NGS

產品規(guī)格

品牌                                   貨號                            名稱                                                            代理商

Rubicon Genomics   R400490   ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit 12Rxns    紅榮微再生物工程技術

Rubicon Genomics   R400491   ThruPLEX Plasma-seq 48S Kit 48Rxns   紅榮微再生物工程技術

Rubicon Genomics   R400492   ThruPLEX Plasma-seq 96D Kit 96Rxns   紅榮微再生物工程技術

 

ThruPLEX® Plasma-seq基于ThruPLEX技術,并用于血漿來源cfDNA高品質NGS文庫構建。

該試劑專門針對cfDNA進行優(yōu)化,在保持樣本GC代表性的基礎上,提升了文庫的信息容量。文庫構建后可用于CNV分析、全基因組測序分析或是采用一些panel針對目標區(qū)域進行捕獲富集后的DNA分析,如Agilent SureSelect® and Roche NimbleGen SeqCap® EZ。

血漿樣品采用ThruPLEX Plasma-seq試劑盒制備文庫,能有更好的靈敏度、更準確的基因變異分析結果。與其它液態(tài)活檢的樣品一樣,血漿由于其易獲得、價值高的特點,深受研究腫瘤學或者孕婦血漿中胎兒游離DNA科研工作者的重視。Rubicon RB4490/R400490 ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit 血漿游離DNA測序試劑盒應用于:胎兒染色體非整倍體檢測試劑盒、*產前基因檢測、腫瘤*檢測、cfDNA血漿游離DNA檢測 、靶向基因檢測試劑。

 

高品質血漿來源cell free DNA NGS文庫構建試劑

ThruPLEX® Plasma-seq Kit

· 專為cfDNA設計:經過優(yōu)化的修復及連接試劑

· 高品質NGS文庫:在寬廣的GC含量范圍內,可以達到高檢測再現性

· 起始量范圍廣:<1 ng到30 ng cfDNA量

· 快速簡便:無需純化或樣品轉移的單管、2小時、3步操作步驟

· 應用領域:液態(tài)活檢、ctDNA、目標區(qū)域測序等領域文庫構建

· 兼容自動化平臺:Beckman® FXP Workstation

 

產品組成

· Template Preparation Buffer(Red)模板準備緩沖液(紅色)

· Template Preparation Enzyme(Red)模板準備酶(紅色)

· Library Synthesis Buffer(Yellow)文庫合成緩沖液(黃色)

· Library Synthesis Enzyme(Yellow)文庫合成酶(黃色)

· Library Amplification Buffer(Green)文庫擴增緩沖液(綠色)

· Library Amplification Enzyme(Green)文庫擴增酶(綠色)

· Nuclease-Free Water(Clear)無核酸酶水

· Indexing Reagent(Blue)or Indexing Plate索引試劑(藍色)

· Quick Protocol(N/A)使用方法

 

■ 保存

-20℃

Rubicon Genomics ThruPLEX Plasma-seq NGS

圖1. ThruPLEX® 技術概要。ThruPLEX Plasma-seq Kit技術3步反應即可完成針對cell free DNA的建庫工作。1~30 ng含量的cf DNA首先高效的進行末端修復。通過采用莖環(huán)形接頭(無單鏈尾巴)進行高效平端連接,降低了背景。封閉的5’端阻止了接頭-接頭二聚體形成。隨后未使用的接頭被降解,進一步降低背景。高保真度擴增的方式完成以上反應,并獲得含有illumina index的文庫。

(*圖片來源于Takara Bio USA,Inc.)

 

圖2. 高cfDNA文庫多樣性、更少的Unmapped Reads。ThruPLEX Plasma-seq Kit構建的文庫,具有高的多樣性和低的duplicates和unmapped reads。圖中表示cfDNA分別提取于3份血漿樣品,文庫定量采用Qubit熒光定量。Bioanalyzer測定mononucleosomal DNA在各樣品的量分別為0.09 ng、0.62 ng、15.44 ng。Pooled libraries采用illumina NextSeq 500 paired end模式測序,且每個文庫產生17 M到25 M reads。每個文庫在down-sampling數據至17 M reads以后,計算Duplication rates。

(*圖片來源于Takara Bio USA,Inc.)

 

圖3. 優(yōu)異的靶向測序文庫構建能力。圖中所示ThruPLEX Plasma-seq Kit構建的文庫通過panel進行高效捕獲,對kinome進行深度測序分析以檢測突變。3個血漿樣品分別起始建庫量為5 ng、6.5 ng、10 ng,三次重復。目標區(qū)域采用SureSelectXT2的ClearSeq Human DNA Kinome Panel進行捕獲,并用Illumina Miseq平臺進行測序,平均每個文庫獲得5 M reads,目標堿基被成功捕獲分析。

(*圖片來源于Takara Bio USA,Inc.)

 

圖4. 高重復性的、無偏倚的GC覆蓋度。針對人類基因組,ThruPLEX Plasma-seq Kit表現出高再現性、低偏倚GC覆蓋度NGS文庫構建能力。9次獨立的血漿樣品文庫構建的實驗結果表明,ThruPLEX重復性高于其它產品。文庫的制備是利用的1 mL血漿來源cfDNA,后續(xù)采用illumina NextSeq 500進行測序。作為對比,A公司試劑構建了4份獨立血漿樣品的文庫。

(*圖片來源于Takara Bio USA,Inc.)

 

圖5. Karolinska協會和CRUK測試的結果。5 ng游離cf DNA采用ThruPLEX Plasma seq Kit進行illumina文庫構建。結果表明利用Hiseq平臺進行的Low-pass WGS,每個文庫能獲得接近12.5 M reads。 

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