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翌圣OnePot 酶切法建庫試劑盒亮相科研期刊

2021-12-13  閱讀(978)

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榮登Nature Methods | 翌圣OnePot 酶切法建庫試劑盒亮相科研期刊

 

 

GUIDE

 導(dǎo)  讀


生物個體所有細(xì)胞的親緣關(guān)系可以用細(xì)胞譜系樹來描述。細(xì)胞譜系對于理解多細(xì)胞生物的胚胎發(fā)育、細(xì)胞分化、器官的維持與衰老等生理病理過程具有重要意義,目前主要通過DNA條形碼(barcode)技術(shù)記錄細(xì)胞分裂過程產(chǎn)生的突變來還原細(xì)胞譜系。然而,目前DNA條形碼技術(shù)的精確度為平均每個條形碼只攜帶3-5個突變,限制了科學(xué)家對復(fù)雜多細(xì)胞生物胚胎發(fā)育的全貌的研究。

 

研 究 內(nèi) 容


中山大學(xué)賀雄雷團(tuán)隊長期致力于DNA條形碼技術(shù)優(yōu)化和創(chuàng)新。2021年12月2日,賀教授團(tuán)隊在Nature 子刊Nature Methods(IF=28)發(fā)文“Mapping single-cell-resolution cell phylogeny reveals cell population dynamics during organ development”,介紹一種基于單堿基突變的細(xì)胞譜系追蹤系統(tǒng)SMALT(substitution mutation aided lineage tracing system),通過SMALT系統(tǒng)構(gòu)建轉(zhuǎn)基因果蠅品系,實現(xiàn)在單細(xì)胞水平上對復(fù)雜多細(xì)胞生物的胚胎發(fā)育過程中細(xì)胞譜系關(guān)系進(jìn)行可靠描述。


▲ 圖源論文,點擊可查看原文


此外,研究人員開發(fā)了利用細(xì)胞譜系樹還原具有分裂活性的祖先細(xì)胞群體數(shù)量的分析方法-ICPD,從細(xì)胞譜系樹推斷各器官發(fā)育過程的群體歷史特征,結(jié)果顯示,不同器官具有*的群體歷史特征,并且該特征在不同個體具有高度一致性。此外,ICPD進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),各器官中分裂產(chǎn)生的細(xì)胞總數(shù)與器官的真實細(xì)胞數(shù)量顯著相關(guān),對其方差解釋度達(dá)到74.5%,這表明細(xì)胞群體的分裂活性對器官大小的穩(wěn)定性具有重要作用。

圖1、果蠅幼蟲各器官的分歧時間.jpg
圖2、分裂細(xì)胞數(shù)與真實器官細(xì)胞數(shù)一致性.jpg

 

翌圣提供NGS建庫完整解決方案


值得一提的是,這篇高水平文章采用翌圣Hieff NGS® OnePot II DNA Library Prep Kit for Illumina® “一步法”DNA建庫試劑盒對果蠅DNA進(jìn)行建庫。該試劑盒采用高質(zhì)量的片段化酶,將片段化模塊與末端修復(fù)模塊合二為一,降低了建庫的時間和成本,可用于500 pg-1 μg動植物基因組、微生物基因組等樣本,同時能兼容FFPE DNA樣本的建庫。經(jīng)測序驗證,不同GC含量的樣本,均可獲得優(yōu)異的測序結(jié)果,使建庫變得更加簡單高效。

 

圖3、賀教授團(tuán)隊建庫使用翌圣建庫試劑盒.jpg圖3.賀教授團(tuán)隊建庫使用翌圣建庫試劑盒


目前翌圣生物針對MGI以及Illumina測序平臺均提供完善的核酸提取以及文庫制備方案,相關(guān)產(chǎn)品經(jīng)過嚴(yán)格的批次性能與穩(wěn)定性質(zhì)控,確保產(chǎn)品的優(yōu)異性能,為研究者進(jìn)行高質(zhì)量的科學(xué)研究提供有力的保障。

 

適用平臺

產(chǎn)品名稱

產(chǎn)品編號

規(guī)格

Illumina機(jī)械法建庫

Hieff NGS® Ultima DNA Library Prep Kit for Illumina® 機(jī)械法DNA建庫試劑盒

12199ES08/12199ES24/12199ES96

8T/24T/96T

Hieff NGS® Ultima Pro DNA Library Prep Kit for Illumina® 機(jī)械法DNA建庫試劑盒

12201ES08/12201ES24/12201ES96

8T/24T/96T

Illumina酶切法建庫

Hieff NGS® OnePot II DNA Library Prep Kit for Illumina® 酶切法DNA建庫試劑盒

12204ES08/12204ES24/12204ES96

8T/24T/96T

Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit for Illumina® DNA 酶切法建庫試劑盒

12205ES08/12205ES24/12205ES96

8T/24T/96T

Illumina轉(zhuǎn)座酶法建庫

Hieff NGS® Fast Tagment DNA Library Prep Kit for Illumina® (for 1 ng)  轉(zhuǎn)座酶法建庫試劑盒(1ng

12206ES08/12206ES24/12206ES96

8T/24T/96T

Hieff NGS® Fast Tagment DNA Library Prep Kit for Illumina® (for 50 ng)  轉(zhuǎn)座酶法建庫試劑盒(50 ng

12207ES08/12207ES24/12207ES96

8T/24T/96T

MGI機(jī)械法建庫

Hieff NGS® Ultima DNA Library Prep Kit for MGI® 機(jī)械法建庫試劑盒

13310ES16/13310ES96/13310ES98

16 T/96 T/192 T

MGI酶切法建庫

Hieff  NGS® OnePot II DNA Library Prep Kit for MGI® 酶切法建庫試劑盒

13321ES16/13321ES96

16T/96T

Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit for MGI® DNA 酶切法建庫試劑盒

13322ES16/13322ES96

16T/96T

文庫分選/純化磁珠

Hieff NGS® DNA Selection Beads 分選磁珠

12601ES08/12601ES56/12601ES75

5mL/60mL/450mL

Qubit文庫定量

dsDNA HS Assay Kit for Qubit® Qubit試劑

12640ES60/12640ES76

100T/500T

1×dsDNA HS Assay Kit for Qubit® Qubit預(yù)混液

12642ES60/12642ES76

100T/500T

 

 

 

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