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質(zhì)粒是攜帶外源基因進(jìn)入細(xì)菌中擴(kuò)增或表達(dá)的主要載體,它在基因操作中具有重要作用。質(zhì)粒的分離與提取是zui常用、zui基本的實(shí)驗(yàn)技術(shù)。
質(zhì)粒的提取方法很多,大多包括3個(gè)主要步驟:細(xì)菌的培養(yǎng)、細(xì)菌的收集和裂解、質(zhì)粒DNA的分離和純化。本實(shí)驗(yàn)以堿裂解法為例,介紹質(zhì)粒的抽提過(guò)程。
實(shí)驗(yàn)?zāi)康模?/strong>掌握堿裂解法抽提質(zhì)粒的原理、步驟及各試劑的作用。
實(shí)驗(yàn)材料:含有質(zhì)粒pUC18載體的大腸桿菌菌液,克隆有水稻外源片段的BAC的大腸桿菌菌液。
實(shí)驗(yàn)原理:在pH 12.0 ~ 12.6堿性環(huán)境中,細(xì)菌的線性大分子量染色體DNA變性分開(kāi),而共價(jià)閉環(huán)的質(zhì)粒DNA雖然變性但仍處于拓?fù)淅p繞狀態(tài)。將pH調(diào)至中性并有高鹽存在及低溫的條件下,大部分染色體DNA、大分子量的RNA和蛋白質(zhì)在去污劑SDS的作用下形成沉淀,而質(zhì)粒DNA仍然為可溶狀態(tài)。通過(guò)離心,可除去大部分細(xì)胞碎片、染色體DNA、RNA及蛋白質(zhì),質(zhì)粒DNA尚在上清中,然后用酚、氯仿抽提進(jìn)一步純化質(zhì)粒DNA。
實(shí)驗(yàn)步驟:
1.取含有pUC18質(zhì)粒的大腸桿菌菌液于LA培養(yǎng)基上37℃過(guò)培養(yǎng);
2.用無(wú)菌牙簽挑取單菌落,接種于含有Amp抗生素的LB培養(yǎng)基中,37℃搖床~250 r/min過(guò)培養(yǎng);
3.吸取1.5 ml菌液,12000 g離心2分鐘,收集菌體,倒掉菌液;吸取1.5 ml菌液,再次收集菌體,盡量將菌液倒干凈;
4.加入300 ml溶液 I振蕩打勻,重新懸浮細(xì)胞,震蕩混勻(注意:應(yīng)*打勻沉淀或碎塊);
5.加入300 ml溶液II,輕柔顛倒混勻,放置至清亮,一般不超過(guò)5分鐘;
6.加入300 ml溶液III顛倒混勻,放置于冰上10分鐘,使雜質(zhì)充分沉淀;
7.12000 g離心10分鐘;
8.吸取800 ml上清液(注意:不要吸取到飄浮的雜質(zhì))至另一Eppendorf管中,加入2/3體積的異丙醇,室溫下放置5分鐘;
9.12000 g 常溫離心15分鐘;
10.倒盡上清,加75%乙醇浸洗除鹽(放置片刻或離心3分鐘后倒去上清);
11.室溫放置或超凈臺(tái)上風(fēng)干DNA;
12.加40 ml滅菌超純水或TE溶解;
13.質(zhì)粒、BAC的質(zhì)量檢測(cè),于-20℃保存。
附注:質(zhì)粒檢測(cè)
電泳檢測(cè):質(zhì)粒電泳一般有三條帶,分別為質(zhì)粒的超螺旋、開(kāi)環(huán)、線型三種構(gòu)型
吸光值檢測(cè):采用分光光度計(jì)檢測(cè)260nm、280nm波長(zhǎng)吸光值,若吸光值260nm/280nm的比值介于1.7-1.9之間,說(shuō)明質(zhì)粒質(zhì)量較好,1.8為*,低于1.8說(shuō)明有蛋白質(zhì)污染,大于1.8說(shuō)明有RNA污染。