酵母雙雜交文庫技術指標:
1、庫容量≥106;
2、文庫滴度≥107cfu/ml;
3、插入片段平均大于1kb(該數(shù)據(jù)以人類樣本構建酵母雙雜文庫的結果為參照,如樣品物種不同,且無參考數(shù)據(jù),則我們不作出承諾);
4、減低高豐度表達基因10-100倍。
技術服務內容:
A、均一化酵母雙雜cDNA文庫
總RNA提取、純化→LD PCR 合成cDNA→cDNA均一化→均一化cDNA產物與線性化的AD質粒共轉化于酵母感受態(tài)(真核生物同源重組修復)→所有轉化液涂于40-100塊15cm平板→計數(shù)文庫→效價→集合所有克隆得到zui終文庫。
B、普通酵母雙雜cDNA文庫
總RNA提取、純化→LD PCR 合成cDNA→cDNA產物與線性化的AD質粒共轉化于酵母感受態(tài)(真核生物同源重組修復)→所有轉化液涂于40-100塊15cm平板→計數(shù)文庫效價→集合所有克隆得到zui終文庫。
材料要求:
為客戶構建的酵母雙雜交cDNA文庫,由客戶提供組織、細胞或總RNA。
服務完成時提供:
A、詳細實驗報告
B、該酵母文庫甘油凍存管
服務周期:獲得合格的總RNA后,45個工作日
目前我們已經分別為*上海植物生理生態(tài)研究所、上海交通大學、浙江大學、浙江省農科院、山東省農科院等多家單位完成酵母雙雜交文庫構建服務,物種包括人、小鼠、水稻、擬南芥、牡丹、稻飛虱等。歡迎隨時與我們!
附:酵母雙雜交原理
酵母雙雜交系統(tǒng)是目前研究蛋白-蛋白相互作用的主流方式之一,這種體外互作實驗是在酵母這種真核細胞生物中進行的,很大程度上模擬了研究材料的體內環(huán)境。簡而言之,該策略就是將編碼誘餌蛋白(Bait)和靶蛋白(Target)的基因分別融合構建于帶有酵母內源轉錄因子基因(例如GAL4)的DNA Binding Domain序列和Activation Domain序列的兩個載體上;由于GAL4調控目標啟動子啟動轉錄需要上述兩個結構域空間上相互接近,即只有當誘餌蛋白與靶蛋白存在相互作用才能使得GAL4蛋白結構完整并啟動報告基因的表達。
報告基因一般選擇某營養(yǎng)物質的合成基因來彌補營養(yǎng)缺陷型酵母宿主菌的缺陷,或者是LacZ這樣的可用于組化顯色的基因。
特點與優(yōu)點:
酵母雙雜交系統(tǒng)的zui主要應用是快速且直接分析已知蛋白之間的相互作用以及分離新的與已知蛋白作用的配體及其編碼它的基因。酵母雙雜交系統(tǒng)檢測蛋白之間的相互作用具有以下優(yōu)點:
1、相互作用的信號是在融合基因表達后,在酵母細胞內重建完整的轉錄因子結構的作用而給出的,省去了純化蛋白質的繁瑣步驟;
2、檢測在真核活細胞內進行,可以在一定程度上代表研究材料細胞內真實情況;
3、檢測的結果可以是基因表達產物的積累效應, 因而可檢測存在于蛋白質之間的微弱的或暫時的相互作用;
4、酵母雙雜交系統(tǒng)可采用不同組織、器官、細胞類型和分化時期材料構建cDNA文庫, 能分析細胞漿、細胞核及膜結合蛋白等多種不同亞細胞部位及功能的蛋白。例如已報道成功分析了RAP1與RIF1ii、P21cip1與CDK2iii、p16與CDK4iv等之間的相互作用。本公司采用CLONTECH的BD MatchmakerTM library, 其LD-PCR策略使得所需材料的總RNA的起始濃度大大減少(1-2mg);
5、可以用來比對病變組織,更快的找到突變基因或者導致變異的蛋白,更快的找到攻克方向;
6、利用研究的已知蛋白基因為誘餌,在已經構建好的某組織材料特異表達的cDNA酵母AD文庫中釣取可能的互作蛋白;
7、采用Yeast mating策略,實現(xiàn)酵母AD文庫使用的反復性,在大規(guī)模高效篩選的同時縮減了研究成本