質(zhì)譜是一種通過測量離子的荷質(zhì)比來識別樣品中分子的應(yīng)用。質(zhì)譜分析儀一般有三個組成部分： 離子源，質(zhì)量分析器，離子檢測器。
樣品被電離后，離子被加速并通過電場和磁場，影響其速度和軌跡。離子改變軌跡的程度取決于 荷質(zhì)比。具有相同荷質(zhì)比的離子將被偏轉(zhuǎn)相同的量。
荷質(zhì)比的差異允許質(zhì)量分析儀對離子進行排序，并根據(jù)荷質(zhì)比顯示檢測到的離子的相對豐度譜。 通過與已知物質(zhì)的荷質(zhì)比對應(yīng)，可以確定樣品的組成部分。
激光在質(zhì)譜應(yīng)用中以兩種不同的方式使用：汽化樣品和電離樣品。
基質(zhì)輔助激光解析電離（MALDI）使用一束激光脈沖同時使樣品汽化和電離。在開始之前，樣品 被混合到一個吸收激光能量的基質(zhì)材料中。脈沖激光觸發(fā)樣品和基質(zhì)材料的剝離和脫落。分子在剝離 氣體的熱流中被電離，然后進行分析。
二級激光質(zhì)譜（L2MS-Two-step laser mass spectrometry）需要兩個不同的激光脈沖進行兩步操作：
第一步，一個紅外脈沖激光聚焦在樣品上，將樣品的中分子快速加熱和汽化。
第二步，一個紫外脈沖激光將脫附的分子電離。
然后對分子進行分析。在這種方法中，汽化和電離是獨立可調(diào)的。這使得可以在復(fù)雜材料中檢測 到微量的有機分子。
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