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前言
Thermo Scientific Ramina 過(guò)程分析儀是一款拉曼光譜分析儀器,旨在為研發(fā)過(guò)程的任何階段提供快速、穩(wěn)健、可擴(kuò)展和可靠的分子識(shí)別、定量和表征。它采用了“一體化"的設(shè)計(jì),利用易于更換的高壓滅菌探頭,滿(mǎn)足但不限于上游生物過(guò)程監(jiān)測(cè)或灌裝和成品表征的各種分析需求。
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化學(xué)計(jì)量學(xué)分析允許用戶(hù)開(kāi)發(fā)一個(gè)數(shù)據(jù)模型,根據(jù)分析儀的數(shù)據(jù)用以監(jiān)測(cè)多種分析物的濃度。從時(shí)間和資源的角度來(lái)看,建立一個(gè)準(zhǔn)確而可靠的化學(xué)計(jì)量學(xué)模型需要大量的投資。因此,化學(xué)計(jì)量模型必須可以在不同儀器之間使用,以充分利用這一投資的價(jià)值。
一旦化學(xué)計(jì)量模型被開(kāi)發(fā)出來(lái),它就可以傳遞給任何 Ramina 過(guò)程分析儀使用,以高度準(zhǔn)確的模型精度并行監(jiān)測(cè)多個(gè)反應(yīng)器。在不同系統(tǒng)硬件之間傳輸化學(xué)計(jì)量學(xué)模型時(shí)保持的測(cè)量準(zhǔn)度和精度,確保了客戶(hù)在使用新儀器或新的高壓滅菌探頭時(shí)不必重新構(gòu)建模型。
實(shí)驗(yàn)設(shè)置
為了證明復(fù)雜的化學(xué)計(jì)量模型的可轉(zhuǎn)移性,我們?cè)u(píng)估了 Gibco™DMEM 生長(zhǎng)介質(zhì)中的三種相關(guān)分析物:葡萄糖、谷氨酰胺和乳酸鹽。三種分析物在生物反應(yīng)器中都在 g/L 濃度范圍內(nèi),葡萄糖在0-12 g/L范圍內(nèi),谷氨酰胺0-2.5 g/L范圍內(nèi),乳酸0-20 g/L范圍內(nèi)。
通過(guò)使用一套校準(zhǔn)標(biāo)準(zhǔn)的 Thermo Scientific Ramina 過(guò)程分析儀中收集光譜,建立了化學(xué)計(jì)量學(xué)模型。在每種分析物的相關(guān)濃度范圍內(nèi),采用均勻設(shè)計(jì)方法選擇24個(gè)隨機(jī)濃度的樣品,然后將該模型應(yīng)用于8個(gè)驗(yàn)證樣品,驗(yàn)證樣品的光譜使用10臺(tái)不同的 Thermo Scientific Ramina 過(guò)程分析儀進(jìn)行測(cè)量。
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為最大限度地提高與分析物濃度對(duì)應(yīng)的特征光譜的信噪比對(duì)采集參數(shù)進(jìn)行了優(yōu)化。優(yōu)化后的參數(shù)為15s積分時(shí)間,450mw 激光功率,自動(dòng)暗背景信號(hào)校正,重復(fù)采集10次光譜后取平均。該模型能夠以非常好的準(zhǔn)確度和精度預(yù)測(cè)8個(gè)樣品驗(yàn)證集所有三種分析物的濃度。
本研究中評(píng)估的每臺(tái) Thermo Scientific Ramina 過(guò)程分析儀都包括一套硬件,由光譜儀主機(jī)、光纖電纜和生物反應(yīng)器探頭組成。每種分析物的平均預(yù)測(cè)誤差為葡萄糖0.21 g/L、谷氨酰胺0.16 g/L、乳酸0.3 g/L。這些結(jié)果證明了這一復(fù)雜的化學(xué)計(jì)量模型可以在多臺(tái) Thermo Scientific Ramina 過(guò)程分析儀之間出色地轉(zhuǎn)移。
模型分析
使用 Eigenvector Solo 軟件建立了一個(gè) PLS 模型,以預(yù)測(cè)每種混合物中的這三種分析物。采用24個(gè)校正樣本,每個(gè)樣本3次重復(fù),建立 PLS 校正模型。所有校準(zhǔn)光譜均使用一臺(tái) Thermo Scientific Ramina 過(guò)程分析儀收集,采用870 ~ 3096 cm-1之間指紋區(qū)的光譜建立模型,采用 SavitskyGolay 平滑濾波器去除隨機(jī)噪聲,提高信噪比。接著對(duì)基線進(jìn)行校正,然后進(jìn)行散射校正和歸一化。此外,在建立模型之前,所有數(shù)據(jù)均進(jìn)行中心均值處理。
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采用去除一個(gè)樣本的交叉驗(yàn)證策略建立校準(zhǔn)模型。同一樣品的3個(gè)重復(fù)在此過(guò)程中一起進(jìn)行。經(jīng)過(guò)這些關(guān)鍵的預(yù)處理和交叉驗(yàn)證步驟,最終選擇了四變量?jī)?yōu)化模型。模型的校準(zhǔn)和交叉驗(yàn)證結(jié)果見(jiàn)下表1。
Analyte | |||
Model Parameter | Glucose | Glutamine | Lactate |
RMSEC (g/L) | 0.079 | 0.075 | 0.146 |
RMSECV (g/L) | 0.095 | 0.088 | 0.176 |
Bias (g/L) | 4.79E-05 | -1.94E-05 | -2.50E-05 |
CV Bias (g/L) | -2.25E-04 | -6.45E-04 | -4.42E-03 |
R2 Calibration | 0.9995 | 0.9902 | 0.9994 |
R2 Cross-Validation | 0.9993 | 0.9864 | 0.9991 |
表1.化學(xué)計(jì)量學(xué)模型的校準(zhǔn)和交叉驗(yàn)證結(jié)果
隨后,用10臺(tái)不同的 Thermo Scientific Ramina 過(guò)程分析儀上收集8個(gè)驗(yàn)證樣品集的光譜。將建立的化學(xué)計(jì)量學(xué)模型應(yīng)用于每臺(tái) Thermo Scientific Ramina 過(guò)程分析儀預(yù)測(cè)分析物濃度。下文討論的結(jié)果表明,在10臺(tái) Thermo Scientific Ramina 過(guò)程分析儀中,三種成分的預(yù)測(cè)都保持了高度的準(zhǔn)確性和精確度。
結(jié)果
開(kāi)發(fā)可靠的化學(xué)計(jì)量模型需要大量的時(shí)間和資源投入。為了確保這項(xiàng)投資為我們的客戶(hù)提供長(zhǎng)期價(jià)值,我們已經(jīng)在眾多 Thermo Scientific Ramina 過(guò)程分析儀上展示了化學(xué)計(jì)量模型的可移植性。下圖1中的相關(guān)圖顯示了葡萄糖(下圖1A)、乳酸(下圖1B)和谷氨酰胺(下圖1C)的預(yù)測(cè)值與參考值。每個(gè)圖包含所有10臺(tái) Thermo Scientific Ramina 過(guò)程分析儀的預(yù)測(cè)值的疊加。通過(guò)10臺(tái)Thermo Scientific Ramina 過(guò)程分析儀,化學(xué)計(jì)量模型的精度為客戶(hù)提供一致的結(jié)果。
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A
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B
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C
下表2顯示了每個(gè) Thermo Scientific Ramina 過(guò)程分析儀上每種分析物的平均預(yù)測(cè)誤差,以及10臺(tái) Thermo Scientific Ramina 過(guò)程分析儀上每種分析物的平均誤差。所有參數(shù)均表現(xiàn)出較高的測(cè)量精度,預(yù)測(cè)誤差小于0.5 g/L。此外,部分預(yù)測(cè)誤差小于0.1 g/L。這一精度水平與其他已發(fā)表的化學(xué)計(jì)量學(xué)建模結(jié)果一致,并與生物反應(yīng)器監(jiān)測(cè)的其他相關(guān)測(cè)量技術(shù)相當(dāng)。
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儀器的準(zhǔn)確性和精確性,可以很容易地將生物反應(yīng)器內(nèi)的葡萄糖濃度控制在典型的2-4 g/L范圍內(nèi)。此外,通過(guò)持續(xù)監(jiān)測(cè)和反饋利用,甚至更嚴(yán)格的控制是可能的,從而改善過(guò)程反應(yīng)和產(chǎn)品的一致性。使用 Thermo Scientific Ramina 過(guò)程分析儀開(kāi)發(fā)的化學(xué)計(jì)量模型在全面的生物反應(yīng)器研究中監(jiān)測(cè)多組分具有出色性能。
Average prediction error (g/L) | |||
Hardware | Glucose | Glutamine | Lactate |
Instrument 1 | 0.18 | 0.05 | 0.20 |
Instrument 2 | 0.11 | 0.13 | 0.40 |
Instrument 3 | 0.12 | 0.15 | 0.21 |
Instrument 4 | 0.18 | 0.14 | 0.26 |
Instrument 5 | 0.18 | 0.08 | 0.40 |
Instrument 6 | 0.40 | 0.11 | 0.25 |
Instrument 7 | 0.13 | 0.38 | 0.32 |
Instrument 8 | 0.21 | 0.11 | 0.26 |
Instrument 9 | 0.47 | 0.15 | 0.44 |
Instrument 10 | 0.09 | 0.34 | 0.23 |
Average error (across 10 systems) | 0.21 | 0.16 | 0.30 |
表2.化學(xué)計(jì)量學(xué)模型計(jì)算預(yù)測(cè)誤差(RMSEP)
結(jié)論
本實(shí)驗(yàn)證明化學(xué)計(jì)量模型可在多個(gè) Thermo Scientific Ramina 過(guò)程分析儀之間轉(zhuǎn)移,為客戶(hù)帶來(lái)了極大的便利。Thermo Scientific Ramina 過(guò)程分析儀能夠跨多個(gè)單元使用相同的化學(xué)計(jì)量模型,為用戶(hù)提供了優(yōu)秀的測(cè)量準(zhǔn)確度和精確度。信號(hào)處理和模型優(yōu)化可以進(jìn)一步提高預(yù)測(cè)的性能水平。本文例子為使用 Thermo Scientific Ramina 過(guò)程分析儀開(kāi)發(fā)化學(xué)計(jì)量模型提供了基本參考。