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模塊式植物表型成像分析系統(tǒng)

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熒光成像熱成像RGB多光譜易科泰

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   北京易科泰生態(tài)技術(shù)有限公司成立于2002年,為中關(guān)村高新技術(shù)企業(yè),致力于生態(tài)-農(nóng)業(yè)-健康研究監(jiān)測(cè)技術(shù)推廣、研發(fā)與服務(wù),特別是在光譜成像技術(shù)(高光譜成像技術(shù)、葉綠素?zé)晒獬上窦夹g(shù)、紅外熱成像技術(shù)、無(wú)人機(jī)遙感等)、植物表型分析技術(shù)、呼吸與能量代謝測(cè)量技術(shù)等方面,與專(zhuān)業(yè)企業(yè)PSI、Specim、Sable等合作,致力于植物科學(xué)、土壤與地球科學(xué)、動(dòng)物能量代謝、水體與藻類(lèi)及生態(tài)環(huán)境領(lǐng)域先進(jìn)儀器技術(shù)的引進(jìn)推廣和技術(shù)研發(fā)集成,為植物/作物表型分析、生態(tài)修復(fù)及生態(tài)保護(hù)、能量代謝測(cè)量等提供規(guī)劃設(shè)計(jì)、技術(shù)方案與系統(tǒng)集成、技術(shù)咨詢(xún)與科技服務(wù)。公司技術(shù)團(tuán)隊(duì)80%以上具備碩士或碩士以上學(xué)位,并與*研究生院、中科院植物研究所、中科院動(dòng)物所、中科院地理科學(xué)與資源研究所、中國(guó)農(nóng)科院、中國(guó)林科院、中國(guó)環(huán)科院、中國(guó)水科院、清華大學(xué)、中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)、北京林業(yè)大學(xué)、北京大學(xué)、中國(guó)海洋大學(xué)、陜西師范大學(xué)、內(nèi)蒙古大學(xué)等建立了長(zhǎng)期的技術(shù)合作交流關(guān)系。


   公司下設(shè)有葉綠素?zé)晒饧夹g(shù)與植物表型業(yè)務(wù)部、EcoTech®實(shí)驗(yàn)室、光譜成像與無(wú)人機(jī)遙感事業(yè)部及無(wú)人機(jī)遙感研究中心(與陜西師范大學(xué)合作建立)、動(dòng)物能量代謝實(shí)驗(yàn)室、內(nèi)蒙古阿拉善蒙古牛生態(tài)牧業(yè)研究院及青島分公司。實(shí)驗(yàn)室擁有葉綠素?zé)晒獬上瘛⑷~綠素?zé)晒鈨x、水體藻類(lèi)熒光儀、SPECIM高光譜儀、WORKSWELL紅外熱成像儀、EasyChem全自動(dòng)化學(xué)分析儀、MicroMac1000水質(zhì)在線監(jiān)測(cè)系統(tǒng)、ACE土壤呼吸自動(dòng)監(jiān)測(cè)系統(tǒng)、SoilBox便攜式土壤氣體通量測(cè)量系統(tǒng)、動(dòng)物呼吸測(cè)量系統(tǒng)、LCpro 光合作用測(cè)量?jī)x、Hood土壤入滲儀、年輪分析儀等各種儀器設(shè)備,可以進(jìn)行實(shí)驗(yàn)研究分析、實(shí)驗(yàn)培訓(xùn)等,歡迎與易科泰生態(tài)研究室開(kāi)展合作研究。


   易科泰公司與歐洲PSI公司(葉綠素?zé)晒饧夹g(shù)與表型分析技術(shù))、美國(guó)SABLE公司(動(dòng)物能量代謝技術(shù))、歐洲SPECIM公司(高光譜成像技術(shù))、歐洲WORKSWELL公司(紅外熱成像技術(shù))、歐洲ATOMTRACE公司(LIBS元素分析技術(shù))、歐洲BCN無(wú)人機(jī)遙感中心、歐洲ITRAX公司(樣芯密度掃描與元素分析)、美國(guó)VERIS公司、英國(guó)ADC公司、德國(guó)UGT公司、歐洲SYSTEA公司等著名生態(tài)儀器技術(shù)領(lǐng)域的研發(fā)機(jī)構(gòu)和廠商建立了密切的合作關(guān)系,在FluorCam葉綠素?zé)晒獬上衽c熒光測(cè)量技術(shù)、PlantScreen植物表型分析技術(shù)、高光譜成像技術(shù)、紅外熱成像技術(shù)、光合作用與植物生理生態(tài)研究監(jiān)測(cè)、土壤呼吸與碳通量研究監(jiān)測(cè)、動(dòng)物呼吸代謝測(cè)量、水質(zhì)分析與藻類(lèi)研究監(jiān)測(cè)、CoreScanner樣芯密度CT與元素分析技術(shù)、LIBS元素分析技術(shù)、無(wú)人機(jī)生態(tài)遙感技術(shù)等生態(tài)儀器技術(shù)及其系統(tǒng)方案集成有著豐富的經(jīng)驗(yàn),成為我國(guó)農(nóng)業(yè)、林業(yè)、地球科學(xué)、生態(tài)環(huán)境研究等領(lǐng)域科技進(jìn)步的重要研究技術(shù)支持力量。由公司研制生產(chǎn)的EcoDrone®無(wú)人機(jī)遙感平臺(tái)、SoilTron®多功能小型蒸滲儀技術(shù)、SoilBox®土壤呼吸測(cè)量技術(shù)、PhenoPlot®輕便型作物表型分析系統(tǒng)、SCG-N土壤剖面CO2/O2梯度監(jiān)測(cè)系統(tǒng)、植物生理生態(tài)監(jiān)測(cè)技術(shù)、動(dòng)物能量代謝測(cè)量技術(shù)等,在中科院修購(gòu)項(xiàng)目、*學(xué)科群項(xiàng)目、CERN網(wǎng)絡(luò)(生態(tài)系統(tǒng)監(jiān)測(cè)網(wǎng)絡(luò))等項(xiàng)目中發(fā)揮重要作用。


   “工欲善其事,必先利其器”,易科泰公司將秉承“利其器,善其事”的經(jīng)營(yíng)理念,為國(guó)內(nèi)生態(tài)-農(nóng)業(yè)-健康研究與發(fā)展提供優(yōu)秀的技術(shù)方案和服務(wù)。


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土壤與植物生理生態(tài)研究監(jiān)測(cè)、環(huán)境氣象監(jiān)測(cè)、水文水質(zhì)及地下水監(jiān)測(cè)、水土保持研究監(jiān)測(cè)、荒漠化監(jiān)測(cè)、精準(zhǔn)農(nóng)業(yè)以及動(dòng)物生態(tài)研究等儀器技術(shù)的引進(jìn)推廣和系統(tǒng)集成,并為生態(tài)環(huán)境實(shí)驗(yàn)研究和規(guī)劃設(shè)計(jì)提供技術(shù)方案和分析測(cè)量。

產(chǎn)地類(lèi)別 進(jìn)口

    太陽(yáng)輻射照射到植物葉片上,其中的藍(lán)色波段和紅色波段大部分被葉片吸收進(jìn)行光合作用,另一部分(包括綠色波段、紅外波段等)以反射光的形式返回到大氣中,少量以熒光的形式發(fā)射到大氣中,還有部分則以熱的形式耗散。通過(guò)對(duì)葉片反射光成像測(cè)量分析(RGB彩色成像、多光譜或高光譜成像等)、多光譜熒光成像測(cè)量分析及葉片溫度測(cè)量分析(紅外熱成像),可以全面分析植物的性狀特征包括外部形態(tài)顏色、光合作用效率、氣孔動(dòng)態(tài)、次級(jí)代謝等形態(tài)與生理生態(tài)特征,使植物表型數(shù)字化、生理生態(tài)及功能可視化。

    模塊式植物表型成像分析系統(tǒng)由植物多光譜熒光成像單元、紅外熱成像單元、RGB彩色成像單元等組成,可全面分析植物葉片及冠層的形態(tài)結(jié)構(gòu)、顏色、光合作用、生理狀態(tài)、氣孔動(dòng)態(tài)、生化色素分布、脅迫生理等,是目前市場(chǎng)上配置最靈活、功能*、性?xún)r(jià)比最高的植物表型與生理生態(tài)觀測(cè)分析系統(tǒng)。

 

中圖:西葫蘆感染病原菌成像分析,其中(a)為RGB彩色成像、(b)為紅外熱成像、(c)為F520綠色熒光成像、(d)為F520/F680綠紅熒光比值成像;下圖:向日葵幼苗列當(dāng)寄生后的多光譜熒光成像

主要功能特點(diǎn)與技術(shù)指標(biāo):

  • 植物多光譜熒光成像技術(shù),可以對(duì)具有4個(gè)特征性波峰的植物熒光光譜進(jìn)行成像分析,進(jìn)而可全面分析植物初級(jí)代謝(光合效率)、次級(jí)代謝、生理生態(tài)、脅迫與抗性篩選等
  • 可選配UV紫外光、白色LED光源(用于模擬自然光源)、青色LED光源(用于氣孔功能研究)、綠色LED光源、紅色LED光源、藍(lán)色LED光源等不同激發(fā)光源
  • 可對(duì)UV紫外光激發(fā)的4個(gè)波峰的熒光進(jìn)行成像分析,包括蘭光440nm(F440)、綠光520nm(F520)、紅光690nm(F690)和遠(yuǎn)紅外740nm(F740),其中F440和F520統(tǒng)稱(chēng)為BGF,由表皮及葉肉細(xì)胞壁和葉脈發(fā)出,F(xiàn)690和F740為葉綠素?zé)晒釩hl-F
  • 紅外熱成像分析單元可測(cè)量分析葉片溫度的異質(zhì)性分布,并通過(guò)選區(qū)(ROI)工具得到不同區(qū)域的最高溫度、最低溫度、平均溫度、溫度分布頻率直方圖等,依次進(jìn)一步分析氣孔導(dǎo)度、水分脅迫等
  • 40倍RGB成像可以對(duì)植物形態(tài)及顏色進(jìn)行分析,既可明察秋毫到氣孔分布,又可大視野宏觀成像分析
  • 配置靈活、使用方便,可選配不同單元組合
  • 適于植物葉片、植物幼苗及小型全株植物,紅外熱成像可應(yīng)用于植物冠層或多株植物成像分析
  • 應(yīng)用于作物遺傳育種、遺傳組學(xué)與表型組學(xué)研究、植物生理生態(tài)學(xué)、植物脅迫生理、抗性篩選等領(lǐng)域

技術(shù)指標(biāo):

  • 紅外熱成像單元:
    • 非制冷紅外焦平面檢測(cè)器(uncooled VOx microbolometer),已經(jīng)過(guò)歐盟標(biāo)注校準(zhǔn),可直接測(cè)量溫度,包括每個(gè)像素點(diǎn)的溫度等
    • 分辨率:640x512像素
    • 光譜范圍:7.5~13.5μm
    • 溫度測(cè)量范圍:-25~150°C
    • 靈敏度:≤0.03(30mK)@ 30
    • 幀頻:9Hz或30Hz,最大60Hz
    • 數(shù)據(jù)傳輸:USB-3或千兆以太網(wǎng)
    • 19mm光學(xué)鏡頭,視野32x26,可選配13mm鏡頭或35mm鏡頭
    • 具備視頻模式和快照模式
    • 具備14種調(diào)色板供任意選擇,可多樣化設(shè)置熱成像假彩色
    • 具備差值功能,可內(nèi)查圖像形成平滑影像以避免像素化
    • 可通過(guò)軟件設(shè)置大氣溫度、濕度、距離等參數(shù)
    • 具備等溫模式功能,包括以上、一下、之間、及以下與以上四種等溫模式
    • 結(jié)果在線報(bào)告功能,自動(dòng)顯示熱影像、時(shí)距圖及影像參數(shù)如發(fā)射率、反射溫度、大氣溫度、濕度、外部光距離、傳播等
    • 影像處理軟件具備ROI選區(qū)功能,包括點(diǎn)、線、折線、矩形等,并可進(jìn)行分區(qū)處理,每個(gè)ROI即時(shí)顯示最小溫度、最高溫度、平均溫度等
    • 熱掃描功能及熱剖面功能:可在線可視化顯示線型ROI溫度值、溫度剖面圖
    • 所有ROI工具的溫度值均可顯示在時(shí)距圖中
    • 防護(hù)級(jí):IP65
    • 工作溫度:-15°C+50°C 
    • 支持GPS信息,可將位置信息顯示在谷歌地圖上
  • 植物多光譜熒光成像
    • 成像面積20x20cm
    • 紫外光激發(fā)多光譜熒光成像包括F440、F520、F690、F740四個(gè)波段的熒光成像
    • 高分辨率CCD鏡頭,20fps、1360x1024像素,有效像素大小為6.45μm,高速USB 2.0 (480Mbits/sec),可像素疊加(binning)以提高靈敏度(2x2,3x3,4x4);具備視頻模式和快照模式
    • 自動(dòng)測(cè)量分析功能(無(wú)人值守):可預(yù)設(shè)1個(gè)或2個(gè)試驗(yàn)程序,系統(tǒng)可自動(dòng)測(cè)量?jī)?chǔ)存
    • 激發(fā)光源包括紫外光、藍(lán)色光源、紅橙色光源,通過(guò)紫外激發(fā)熒光與紅光LED激發(fā)熒光,可以分析植物類(lèi)黃酮相對(duì)含量等
    • 成像分析軟件具Live(實(shí)況測(cè)試)、Protocol(實(shí)驗(yàn)程序選擇)、Pre-processing(成像預(yù)處理)、Result(成像分析結(jié)果)等功能菜單
    • 成像預(yù)處理可以自動(dòng)選區(qū)或手動(dòng)選擇不同形狀、不同數(shù)量、不同位置的區(qū)域(Region of interest,ROI),成像分析結(jié)果包括高時(shí)間解析度熒光動(dòng)態(tài)圖、直方圖、不同參數(shù)成像圖、不同ROI的熒光參數(shù)列表等
    • Protocol實(shí)驗(yàn)程序可自由編輯,也可利用Protocol菜單中的向?qū)С绦蚰0婵蛻糇杂蓜?chuàng)建新的實(shí)驗(yàn)程序
    • 多種Protocols供選配和自動(dòng)運(yùn)行,包括Fv/Fm、Kautsky誘導(dǎo)效應(yīng)、葉綠素?zé)晒獯銣缜€、光響應(yīng)曲線等
    • 具備系統(tǒng)自動(dòng)重復(fù)運(yùn)行功能,可無(wú)人值守自動(dòng)循環(huán)完成選定的實(shí)驗(yàn)程序,重復(fù)次數(shù)及間隔時(shí)間客戶自定義,成像測(cè)量數(shù)據(jù)自動(dòng)按時(shí)間日期存入計(jì)算機(jī)
    • 高度可調(diào),以適應(yīng)不同高度植株成像分析,最大植株高度50cm,可根據(jù)客戶需求定制不同高度

3. NDVI與PAR吸收成像模塊:630nmLED紅色光源和740nm LED紅外光源,可對(duì)PAR(光合有效輻射)吸收及植物光譜反射指數(shù)NDVI成像分析

 

4. 可對(duì)綠色熒光蛋白GFP進(jìn)行成像分析,可選配YFP成像分析

5. RGB成像:科研級(jí)RGB成像鏡頭,分辨率2592x1944像素,信噪比54dB,1-40x放大,最小視野6.1x7.9mm(40x),最大視野20.8x25.4;可分析葉面積、長(zhǎng)度、寬度、周長(zhǎng)、比值、綠度指數(shù)、顏色分級(jí)分析、頻率直方圖等

 

應(yīng)用案例與近期代表性參考文獻(xiàn):

 

西葫蘆感染軟腐病菌(Dickeya dadantii)RGB彩色成像、多光譜熒光成像及紅外熱成像分析(引自Maria L. Perez-Bueno等,Multicolor Fluorescence Imaging as a Candidate for Disease Detection in Plant Phenotyping. Frontiers in Plant Science, 2016)

  • Monica Pineda etc. Detection of Bacterial Infection in Melon Plants by Classification Methods Based on Imaging Data. Frontiers in Plant Science
  • Monica Pineda et. Use of multicolour fluorescence imaging for diagnosis of bacterial and fungal infection on zucchini by implementing machine learning. Functional Plant Biology, 2017
  • Carmen M. Ortiz-Bustos etc. Fluorescence Imaging in the Red and Far-Red Region during Growth of Sunflower Plantlets. Diagnosis of the Early Infection by the Parasite Orobanche Cumana. Frontiers in Plant Science, 2016
  • Maria Luisa Perez-Bueno etc. Spatial and temporal dynamics of primary and secondary metabolism in Phaseolus vulgaris challenged by Pseudomonas syringae. Physiologia Plantarum, 2015


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